Le Léman fait l'objet d'un suivi continu et international qui s'est structuré à partir de la fin des années 50s, en réponse à la pollution grandissante des eaux due à l’anthropisation du bassin versant. Au fil des années et avec de nouvelles possibilités analytiques, le nombre de paramètres mesurés et analysés a augmenté. A la chimie classique et à l’étude du plancton (phyto et zoo) s’ajoutent les micropolluants (réalisés par des laboratoires suisses), les compartiments microbiens, etc. La zone d’étude s’élargit, avec des mesures sur le bassin versant (suivi de la Dranse) et une attention particulière au fond du lac, siège du phénomène de re-largage du phosphore. Ce suivi est réalisé pour une large part par l’UMR CARRTEL (suivi chimique et biologique de la principale station de mesure SHL2), au bénéfice et sous l’égide de la CIPEL (Commission Internationale pour la de Protection des Eaux du Léman). Chaque année un rapport complet est publié.