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Dernière mise à jour : Mai 2021

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SAPS - Sciences Animales Paris-Saclay

Le projet H2020 RUMIGEN réunit un consortium européen de 18 partenaires

European commission
Le « fil rouge » du projet RUMIGEN est l’adaptation des ruminants au changement climatique de plus en plus prégnant avec le développement de nouvelles stratégies d’élevage susceptibles de « tamponner » ses effets. Trois unités SAPS sont impliquées dans ce projet : les UMR BREED, GABI et VIM.

Le projet RUMIGEN vise à améliorer la sélection génomique chez les bovins (Holstein et autres races), en s’appuyant sur trois leviers scientifiques de la biologie animale :

  • (i) la génétique quantitative (WP3 & 4),
  • (ii) les nouvelles technologies de modification ciblée du génome (GE : Genome Editing, WP5), et l’épigénétique (WP6 & 7).

Outre ces leviers biologiques, le projet RUMIGEN fait intervenir un levier en sciences humaines et sociales (WP2) afin de proposer des nouvelles méthodes de sélection validées par des citoyens Européens (WP8 & 9) susceptibles d’être plus acceptées par la société que certaines pratiques actuelles dont quelques-unes feront également l’objet d’évaluation (Insémination Artificielle, Transfert Embryonnaire, par exemple).

Les WP3 & 4 ont pour ambition, entre autres, de prendre en compte le comportement des animaux lors de périodes de forte température (canicule) dans les schémas de sélection et d’élargir les critères de sélection pour augmenter la résilience des animaux (prendre en compte l’interaction génotype/environnement).

Le WP5 fera un bilan de différents exemples où le GE pourrait être utile chez les ruminants, testera l’impact putatif du GE sur le taux de mutations de novo et enfin proposera deux exemples concrets de GE chez la chèvre et le mouton.

Les WP6 & 7 ont pour objectifs de développer un outil d’épigénotypage à haut débit (puce), de tester cet outil pour déterminer les profils de méthylation de l’ADN dans différents tissus et différentes conditions d’élevage, et au final, d’intégrer ces données d’épigénotypages dans les équations de sélection génomique si la détermination de l’épigénotype diminue la part variable (inconnue) des présentes équations.

Towards improvement of ruminant breeding through genomic and epigenomic approaches
EU H2020 Project with 18 partners across EU with a total grant of ca. 7 Million € for all partners for 4 years.
Short title : Genomics and Epigenomic approaches in Cattle Breeding
Acronym : RumiGEN
Effective start/end date 01/03/2021 → 01/03/2025
Keywords : Genomics, Epigenetics, Bioinformatics, Cattle,  Breeding, Sustainability, Quantitative, Genetics, Greenhouse, gas emissions
Coordination: E. Pailhoux / INRAE-Tranfert (WP1)
Budget global 7 M€
Consortium RUMIGEN : 18 partenaires dont 5 Français (INRAE, INRAE-Transfert, ALLICE, IDELE et VALOGENE), 3 Danois (DBT : Danish Board of Technology, Univ. d’Aarhus, Univ. Technologique du Danemark) 1 Italien (EAAP), 3 Hollandais (EFFAB et Wageningen Research & Univ.), 1 Belge (GIGA-Liège), 2 Espagnols (INIA et IRIAF), 1 Norvégien (NMBU : Univ. Norvégienne pour les sciences de la vie), 1 Suédois (SLU : Univ. Suédoise des sciences agricoles) et 1 Ecossais (Univ. Edimbourg – ROSLIN Inst.).