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Dernière mise à jour : Mai 2018

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SPS - Saclay Plant Sciences

02/10/2020 Ingénieur.e d'étude - BIOlogie et Gestion des Risques en Agriculture (BIOGER), Thiverval-Grignon

Caractérisation des activités biologiques de métabolites spécialisés issus de plantes et de champignons pathogènes de plantes

Localisation du poste : Unité de recherche en BIOlogie et Gestion des Risques en Agriculture (BIOGER), Thiverval-Grignon. Déplacements en Île-de-France (Versailles, Gif-sur-Yvette).

Statut : CDD
Durée : 12 mois renouvelables
Niveau d’étude attendu : BAC + 5
Salaire : selon expérience professionnelle antérieure, entre 2000 euros et 2300 euros brut.

Modalités de candidature

Un dossier de candidature comportant une lettre de motivation et un CV détaillé incluant deux référents scientifiques doit être envoyé à muriel.viaud@inrae.fr.

Date limite d’envoi des candidatures : 01/12/2020
Les candidats dont le dossier aura été retenu seront invités à passer un entretien.
Prise de fonction : 1er trimestre 2021.

Contexte et environnement du poste

Le réseau Sciences des Plantes de Saclay (SPS ; www.saclayplantscience.fr  ) regroupe une cinquantaine d'équipes de recherche spécialisées dans les sciences du végétal réparties sur plusieurs sites du périmètre de l’Université Paris-Saclay. L’un des projets phares de SPS est dédié aux métabolites spécialisés produits par les plantes et les champignons pathogènes de plantes. L’objectif des chercheurs est de comprendre le rôle des métabolites spécialisés dans les interactions biotiques mais également de valoriser ces produits d’origine naturelle. Dans le cadre de ce projet, SPS souhaite mettre en place un ensemble de cribles biologiques et ainsi constituer une « boite à outils » commune pour l’étude des métabolites spécialisés.

Missions

La mission principale de la personne recrutée sera de mettre en place des tests biologiques pour évaluer les activités anti-microbiennes de métabolites spécialisés. Elle sera notamment amenée à développer des approches de néphélométrie pour établir des courbes de croissance d’organismes filamenteux.
Un second volet du programme consistera à cribler les activités des métabolites de champignons phytopathogènes sur des plantes modèles dont Arabidopsis thaliana pour laquelle on dispose de lignées « rapportrices » permettant de visualiser l’activation de certains processus biologiques d’intérêt (voies de signalisation, synthèse pariétale, stress oxydatif, etc.).
L’ensemble du projet implique une gestion rigoureuse des cultures de microorganismes et de plantes mais également des panels de métabolites, un goût pour la mise au point d'essais contrôlés, une aptitude à travailler en équipe et à communiquer avec les chercheurs de différents laboratoires.

Activités

- Cultures de microorganismes (champignons et bactéries)
- Établissement de courbes de croissance par néphélométrie
- Mesures d’activités antibiotiques et antifongiques
- Cultures de plantes
- Tests de phytotoxicité
- Analyse de taille de plantes et de colorations par microscopie photonique ou à épifluorescence
- Expression de gènes par qRT-PCR
- Localisation de protéines fluorescentes par microscopie confocale
- Analyses statistiques
- Synthèse écrite et présentation orale des résultats
- Bibliographie scientifique en anglais

Mots clefs : Métabolites Spécialisés (MS), Interactions biotiques, Cribles biologiques, Phénotypage, Champignons filamenteux, Bactéries, Produits naturels, Antibiotique, Antifongique, Stimulateurs de croissance

Encadrement principal : Muriel Viaud (BIOGER)
Autres contacts scientifiques : Richard O’Connell (BIOGER), Samantha Vernhettes (IJPB, Versailles), Marie Dufresne (IPS2, Gif/Yvette) et Benoit Alunni (I2BC, Gif/Yvette)

Profil recherché

Formation : Bac +5

Compétences requises :
1. Obligatoires
- Microbiologie
- Biologie moléculaire : extraction d’ADN, PCR
- Maitrise de l’anglais scientifique
- Maitrise du logiciel Excel

2. Souhaitées
- Mycologie
- Biologie végétale (expérience avec la culture des plantes)
- Microscopie
- PCR quantitative
- Permis de conduire

Qualités attendues :
- Rigueur, persévérance
- Curiosité scientifique
- Capacité au travail en autonomie et à la prise d'initiative
- Capacité à rédiger des documents de synthèse et à communiquer oralement ses résultats en réunion