En savoir plus

Notre utilisation de cookies

« Cookies » désigne un ensemble d’informations déposées dans le terminal de l’utilisateur lorsque celui-ci navigue sur un site web. Il s’agit d’un fichier contenant notamment un identifiant sous forme de numéro, le nom du serveur qui l’a déposé et éventuellement une date d’expiration. Grâce aux cookies, des informations sur votre visite, notamment votre langue de prédilection et d'autres paramètres, sont enregistrées sur le site web. Cela peut faciliter votre visite suivante sur ce site et renforcer l'utilité de ce dernier pour vous.

Afin d’améliorer votre expérience, nous utilisons des cookies pour conserver certaines informations de connexion et fournir une navigation sûre, collecter des statistiques en vue d’optimiser les fonctionnalités du site. Afin de voir précisément tous les cookies que nous utilisons, nous vous invitons à télécharger « Ghostery », une extension gratuite pour navigateurs permettant de les détecter et, dans certains cas, de les bloquer.

Ghostery est disponible gratuitement à cette adresse : https://www.ghostery.com/fr/products/

Vous pouvez également consulter le site de la CNIL afin d’apprendre à paramétrer votre navigateur pour contrôler les dépôts de cookies sur votre terminal.

S’agissant des cookies publicitaires déposés par des tiers, vous pouvez également vous connecter au site http://www.youronlinechoices.com/fr/controler-ses-cookies/, proposé par les professionnels de la publicité digitale regroupés au sein de l’association européenne EDAA (European Digital Advertising Alliance). Vous pourrez ainsi refuser ou accepter les cookies utilisés par les adhérents de l'EDAA.

Il est par ailleurs possible de s’opposer à certains cookies tiers directement auprès des éditeurs :

Catégorie de cookie

Moyens de désactivation

Cookies analytiques et de performance

Realytics
Google Analytics
Spoteffects
Optimizely

Cookies de ciblage ou publicitaires

DoubleClick
Mediarithmics

Les différents types de cookies pouvant être utilisés sur nos sites internet sont les suivants :

Cookies obligatoires

Cookies fonctionnels

Cookies sociaux et publicitaires

Ces cookies sont nécessaires au bon fonctionnement du site, ils ne peuvent pas être désactivés. Ils nous sont utiles pour vous fournir une connexion sécuritaire et assurer la disponibilité a minima de notre site internet.

Ces cookies nous permettent d’analyser l’utilisation du site afin de pouvoir en mesurer et en améliorer la performance. Ils nous permettent par exemple de conserver vos informations de connexion et d’afficher de façon plus cohérente les différents modules de notre site.

Ces cookies sont utilisés par des agences de publicité (par exemple Google) et par des réseaux sociaux (par exemple LinkedIn et Facebook) et autorisent notamment le partage des pages sur les réseaux sociaux, la publication de commentaires, la diffusion (sur notre site ou non) de publicités adaptées à vos centres d’intérêt.

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit des cookies sessions CAS et PHP et du cookie New Relic pour le monitoring (IP, délais de réponse).

Ces cookies sont supprimés à la fin de la session (déconnexion ou fermeture du navigateur)

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit du cookie XiTi pour la mesure d’audience. La société AT Internet est notre sous-traitant et conserve les informations (IP, date et heure de connexion, durée de connexion, pages consultées) 6 mois.

Sur nos CMS EZPublish, il n’y a pas de cookie de ce type.

Pour obtenir plus d’informations concernant les cookies que nous utilisons, vous pouvez vous adresser au Déléguée Informatique et Libertés de l’INRA par email à cil-dpo@inra.fr ou par courrier à :

INRA
24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

Menu Logos Tutelles

SPS - Saclay Plant Sciences

Projet 1: Analyse intégrative des réponses au stress

Coordination: Heribert Hirt / Jean Colcombet

Résumé:

L'objectif du projet était de comprendre les mécanismes moléculaires qui se produisent dans le temps et l'espace pour contrôler l'expression des gènes des plantes en réponse aux défis environnementaux. À cette fin, nous avons développé un pipeline de phosphoprotéomique pour analyser les événements de signalisation en réponse aux stress et analysé les évènements associés aux agents pathogènes (PAMP) chez Arabidopsis. Dans le cadre du projet, nous avons pu identifier un grand ensemble de nouvelles protéines de chromatine qui sont phosphorylées en réponse à la signalisation PAMP. Plusieurs de ces facteurs ont été identifiés comme des cibles des MAPKs et un peu mieux caractérisés dans le contexte de l'immunité déclenchée par des PAMPs.

Objectifs:

Comprendre les mécanismes moléculaires qui se produisent dans le temps et l'espace pour contrôler l'expression des gènes chez les plantes en réponse aux défis environnementaux

Principaux résultats:

Nous avons développé un pipeline de phosphoprotéomique pour analyser les événements de signalisation en réponse aux stress. Nous avons identifié un grand ensemble de nouvelles protéines qui deviennent phosphorylées en réponse à la flagelline. Nous avons identifié et caractérisé la fonction de plusieurs nouvelles cibles de MAPKs.

Perspectives:

La caractérisation fonctionnelle du nouvel ensemble de cibles MAPK est en cours et révèle comment la signalisation chez les plantes régule la machinerie épigénétique.

Publications (en septembre 2019):

Berriri S., Garcia A.V., Frey N.F.D., Rozhon W., Pateyron S., Leonhardt N., Montillet J.-L., Leung J., Hirt H., Colcombet J. (2012). Constitutively Active Mitogen-Activated Protein Kinase Versions Reveal Functions of Arabidopsis MPK4 in Pathogen Defense Signaling. Plant Cell 24(10): 4281-4293.

Bigeard J., Rayapuram N., Bonhomme L., Hirt H., Pflieger D. (2014). Proteomic and phosphoproteomic analyses of chromatin-associated proteins from Arabidopsis thaliana. Proteomics 14(19): 2141-2155.

Bigeard J., Rayapuram N., Pflieger D., Hirt H. (2014). Phosphorylation-dependent regulation of plant chromatin and chromatin-associated proteins. Proteomics 14(19): 2127-2140.

Frey N.F.D., Garcia A.V., Bigeard J., Zaag R., Bueso E., Garmier M., Pateyron S., de Tauzia-Moreau M.-L., Brunaud V., Balzergue S., Colcombet J., Aubourg S., Martin-Magniette M.-L., Hirt H. (2014). Functional analysis of Arabidopsis immune-related MAPKs uncovers a role for MPK3 as negative regulator of inducible defences. Genome Biology 15(6): R87.

Genot B, Lang J, Berriri S, Garmier M, Gilard F, Pateyron S, Haustraete K, Van Der Straeten D, Hirt H, Colcombet J*. (2017) Constitutively active Arabidopsis MAP Kinase 3 triggers defense responses involving salicylic acid and SUMM2 resistance protein. Plant Physiol. 174:1238

Jegu T., Latrasse D., Delarue M., Hirt H., Domenichini S., Ariel F., Crespi M., Bergounioux C., Raynaud C., Benhamed M. (2014). The BAF60 Subunit of the SWI/SNF Chromatin-Remodeling Complex Directly Controls the Formation of a Gene Loop at FLOWERING LOCUS C in Arabidopsis. Plant Cell 26(2): 538-551.

Jiang Y, Han B, Zhang H., Mariappan K, Bigeard J, Colcombet J, Hirt H (2019). MAP4K4 associates with BIK1 to regulate plant innate immunity. EMBO reports 20(11):e47965

Latrasse D., Jegu T., Meng P.-H., Mazubert C., Hudik E., Delarue M., Charon C., Crespi M., Hirt H., Raynaud C., Bergounioux C., Benhamed M. (2013). Dual function of MIPS1 as a metabolic enzyme and transcriptional regulator. Nucleic Acids Research 41(5): 2907-2917.

Latrasse D., Jégu T., Li H., de Zelicourt A., Raynaud C., Legras S., Gust A., Samajova O., Veluchamy A., Rayapuram N., Ramirez-Prado J., Kulikova O., Colcombet J., Bigeard J., Genot B., Bisseling T., Benhamed M., Hirt H. (2017). MAPK-triggered chromatin reprogramming by histone deacetylase in plant innate immunity. Genome Biology 18: 131.

Rayapuram N., Bonhomme L., Bigeard J., Haddadou K., Przybylski C., Hirt H., Pflieger D. (2014). Identification of Novel PAMP-Triggered Phosphorylation and Dephosphorylation Events in Arabidopsis thaliana by Quantitative Phosphoproteomic Analysis. Journal of Proteome Research 13(4): 2137-2151.

Rayapuram N, Bigeard J, Alhoraibi H, Bonhomme L, Hesse AM, Vinh J, Hirt H, Pflieger D. (2018) Quantitative Phosphoproteomic Analysis Reveals Shared and Specific Targets of Arabidopsis Mitogen-Activated Protein Kinases (MAPKs) MPK3, MPK4, and MPK6. Mol Cell Proteomics. 17(1):61-80.

Vandenbogaert M., Hourdel V., Jardin-Mathe O., Bigeard J., Bonhomme L., Legros V., Hirt H., Schwikowski B., Pflieger D. (2012). Automated Phosphopeptide Identification Using Multiple MS/MS Fragmentation Modes. Journal of Proteome Research 11(12): 5695-5703.

Völz R, Kim SK, Mi J, Mariappan KG, Guo X, Bigeard J, Alejandro S, Pflieger D, Rayapuram N, Al-Babili S, Hirt H. (2018) The Trihelix transcription factor GT2-like 1 (GTL1) promotes salicylic acid metabolism, and regulates bacterial-triggered immunity. PLoS Genet. 14(10):e1007708

Communications lors de congrès:

Heribert Hirt – “Signal transduction and gene expression at the chromatin level” - Gordon Research Conferences: Posttranslational Modification Networks - Phosphosignaling, The Hong Kong University of Science and Technology, Hong Kong, 28 juillet – 2 août 2013

Delphine Pflieger - “Phosphoproteomics of the chromatin in Arabidopsis thaliana subjected to biotic stress” - 3rd European Plant Chromatin Workshop, Madrid, 29-30 août 2013

Heribert Hirt – “Post-translational proteomic approaches to investigate signal transduction of plant-pathogen interactions” - Plant Biology Lectures, Buenos Aires, Argentina, 13-15 novembre 2013

Heribert Hirt – “From signal to chromatin” - Plant Signaling Meeting, Cologne, Germany, 25-27 mars 2014

Heribert Hirt – “Post-translational signal transduction mechanisms in plant microbe interactions” -- Plant Signaling and Networks, Gordon Conference, New Hampshire, USA, 20-25 juillet 2015

Naganand Rayapuram – “Identification of MPK3, MPK4 and MPK6 target by phosphoproteomics” – Gordon Conference on Post-Translational Modification Networks, Hong Kong, China, 11-18 août 2017

Heribert Hirt – “From signaling to chromatin” – Taiwan Academy of Sciences, Taipei, Taiwan, 21 août 2017

Heribert Hirt – “From signaling to chromatin” – Biotic Stress Conference, Shanghai, China, 22-24 août 2017

Autres productions:

Le programme développé est disponible sur la page: http://proteomics.fr/FragMixer/