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24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

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Protéomique - PAPPSO (GQE-Le Moulon)

Protéomique - PAPPSO (GQE-Le Moulon)
GQE-Le Moulon – Gif-sur-Yvette
GQE-Le Moulon

Prestations

  • Identification et quantification de protéines par spectrométrie de masse (LC-MS/MS)
  • Identification et quantification de modifications post-traductionnelles  par spectrométrie de masse (LC-MS/MS)
  • Développement d’outils bioinformatiques, destinés à faciliter et à automatiser l'analyse de données protéomiques (protein identification, quantification, statistiques)
  • Formations des utilisateurs et collaborateurs à l'utilisation des outils bioinformatiques développés et mis à disposition par la plateforme

Principaux équipements

Spectromètres de masse (LC-MS/MS):
  • Orbitrap Fusion Lumos Tribrid (Thermo, acquis en décembre 2015, premier installé en France), couplé à une nanoUPLC (Ultimate 3000 RSLCnano, Thermo)
    > Caractérisations de multiples modifications post traductionnelles
  • Qexactive (Thermo), couplé à une nanoUPLC (nanoLC-Ultra 2D, Eksigent)
    > Analyse de mélanges protéiques complexes (identification et quantification) ou détermination de modifications post-traductionnelles
  • LTQ-Orbitrap (Themo), couplé à une nanoUPLC (Ultimate 3000 RSLCnano, Thermo)
    > Analyses d'identification et de quantification de mélanges protéiques
  • LTQ-ETD (Thermo), couplé à une nanoUPLC (en cours de remplacement)
    > Identification sur des spots 2D ou bande SDS-PAGE
Préparation des échantillons :
  • 2 systèmes chromatographiques pour la séparation des protéines/peptides en amont de l'analyse en LC-MS/MS :
    - Système à basse pression (FPLC ÄKTA Purifier, Amersham)
    - Système à haute pression (HPLC Ultimate, Dionex)
  • Robot de digestion permettant l'hydrolyse de protéines en gel (Progest, Genomic Solution)

Responsable de la plateforme

Adresse

Site du Moulon
Michel Zivy
Responsable scientifique Site du Moulon
Responsable de la plateforme
michel.zivy[at]inrae.fr
01 69 33 23 65
> Biologie végétale

Site du Moulon :
UMR Génétique Quantitative et Evolution – Le Moulon
PAPPSO
Ferme du Moulon
91190 Gif sur Yvette

Site de Jouy-en-Josas
Véronique Monnet
Responsable scientifique Site de Jouy
Co-responsable de la plateforme
veronique.monnet[at]inrae.fr
01 34 65 21 49
> Analyse des bactéries, de leurs protéines membranaires et pariétales / Analyse du peptidome

Site de Jouy :
UMR MICALIS
PAPPSO
Bâtiment 526
Domaine de Vilvert
78352, Jouy en Josas cedex

Sites Web

http://pappso.inrae.fr/

IBISA
Label CNOC

Plateforme Stratégique Nationale