Au cours de l’année 2014, la plateforme Phenoscope de l’Observatoire du Végétal (OV), située sur le centre Inra de Versailles-Grignon, a acquis deux nouveaux robots de phénotypage. Ces machines, actuellement en période de tests, seront bientôt disponibles pour de nouveaux projets de recherche.

Le Phenoscope possède déjà deux robots du même type. L’utilisation de ces robots a été validée dans le cadre d’un projet européen (ERC : European Research Council) mené par Olivier Loudet, généticien quantitatif et directeur de recherche à l’Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB). Le projet avait pour objectif l’étude de la variabilité naturelle chez Arabidopsis thaliana.

Phenoscope from Labex SPS on Vimeo.

Principe de fonctionnement du robot

Ces robots permettent de réaliser du phénotypage haut débit. La croissance de la plante peut être étudiée sans les contraintes environnementales habituelles. En effet, dans une serre classique, la température par exemple peut varier suivant la saison, la position, etc...

Des plantes avec différents génotypes sont cultivées sur le robot, perpétuellement en mouvement, dans des conditions équivalentes de lumière, de température et d’arrosage. L’étude de leur phénotype en lien avec leur génotype permet d’établir une cartographie de QTL (Quantitative Trait Loci).

Sur une période d’environ 21 jours, le système permet la culture de plus de 700 plantes d’Arabidopsis thaliana jusqu’au début de la floraison.

Mesure de la croissance foliaire

Une caméra prend une photo par jour de chaque plante et mesure la surface de la rosette.

Le système est capable d’enregistrer des données de taille et d’établir une courbe de croissance pour chaque plante.

Analyse d’image infrarouge

Une caméra infra-rouge prend des photos, puis un logiciel analyse les variations de couleur et en déduit les températures des feuilles.

Pour en savoir plus, consultez le site de l’Observatoire du Végétal.