Contenu détaillé

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Techniques de pointe en microbiologie pour caractériser et comprendre les cycles de la matière organique (MICMO)

Ecole-chercheur/école thématique organisée en partenariat avec les laboratoires Eco&Sols et CEFE à Montpellier

à Balaruc-les Bains, près de Sète du 24 au 29 mars 2019 

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Lien pour la pré-inscription :
https://goo.gl/forms/dNxZ6huB4AWC5orx1

Le comité d'organisation
Laetitia BERNARD
Alain BRAUMAN
Tiphaine CHEVALLIER
Marie-France DIGNAC
Nathalie FROMIN
Sophie PLEINET

Objectifs de la formation 

  • Définir et partager un vocabulaire commun en écologie microbienne ; 
  • Sensibiliser et familiariser les participants aux nouveaux outils et approches microbiologiques pour qu’ils s’approprient la démarche d’utilisation de ces outils ; 
  • Appréhender les possibilités et les limites des outils présentés (possibilités conceptuelles et pratiques) pour pouvoir les utiliser pour leurs propres questions de recherche ; 
  • Enrichir les questions des participants sur le lien entre fonctions et dynamiques des matières organiques et microbiologie (Qui ? Où ? Combien ? Quand ? Comment ?) ; 
  • Réfléchir à la démarche nécessaire à l’utilisation des grandes quantités de données produites par ces outils (métadonnées) ; 
  • Débattre de la pertinence des échelles d’étude microbiologique pour l’étude des MO ; 
  • Sensibiliser les participants à d’autres formes d’écriture pour expliquer sa recherche. Ecrire pour être lu par des non spécialistes (scientifiques d’autres disciplines et non scientifiques) dans un contexte pluridisciplinaire. 

Programme pédagogique

  • Présentations d’experts sur les apports de différentes techniques analytiques en écologie microbienne (NGS, microscopie, optodes, isotopie, enzymologie…) 
  • Visites commentées de plateformes analytiques (Ecotron, plateforme NGS du Labex CEMEB, ateliers d’Eco&sols, et labos du LBE de Narbonne). 
  • Travaux pratiques sur le traitement des données NGS*. 
  • Présentation de Startup locales en biotechnologie. 
  • Travaux en sous-groupes sur l’intérêt de chaque technique à répondre à une question donnée, et aux objectifs scientifiques des participants. 
  • Ateliers d’écriture – Apprentissage de la vulgarisation scientifique. 

Informations pratiques

Dates et lieu : Du dimanche 24 mars (fin d’après midi) au vendredi 29 mars (midi) à Balaruc-les Bains, près de Sète.

Public visé : Ingénieurs et techniciens, chercheurs, enseignant-chercheurs, doctorants et post-doctorants avec ou non des connaissances en microbiologie. 

Frais d’inscription : 800 € (incluant les frais pédagogiques, l’hébergement et les repas pour toute la durée de la formation), prise en charge par la Formation Permanente CNRS pour les agents CNRS, pour les agents INRA et IRD conditions en cours de négociation.

Date de modification : 04 juillet 2023 | Date de création : 24 janvier 2019 | Rédaction : MFD