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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2021

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Réseau IN-OVIVE

Séminaire In-OVIVE du 21 septembre 2021

en distanciel

Liste des présentations

Programme

10h00-10h10 : Présentation du réseau In-OVIVE

10h10-11h00 : Présentation invitée par Thomas Guyet (INRIA): « Raisonner sur les données médico-administratives pour reconstruire et analyser les parcours de soins » - Présentation - Vidéo

Resumé:

Les données médico-administratives désignent l'ensemble des informations collectées par une organisation de santé pour des raisons administratives (e.g. données de remboursements) et qui contiennent de manière indirecte une information médicale. Ces données sont collectées de manière plus systématique que des données médicales et offrent une vue unifiée sur de larges populations. Leur utilisation à des fins épidémiologiques reste néanmoins difficile du fait de l'écart sémantique qui existe entre la donnée brute et l'utilisation qui en est souhaité.
Les approches de raisonnement automatique basés sur l'utilisation d'ontologies ont montré leur intérêt dans ce type de problème.
Au cours de cette présentation, nous présenterons des travaux en cours sur l'utilisation de méthodes de raisonnement ontologiques et temporels afin d'exploiter les données médico-administratives (données SNDS historiques, données hospitalières) pour études épidémiologiques. L'enrichissement des données vise notamment à raisonner sur le parcours
de soin des patients. Deux types de tâches d'analyse sont plus particulièrement explorées :
la préparation des parcours de soins (temporal data wrangling) et l'extraction de motifs temporels fréquents dans les parcours.

11h00-12h00 : Exposés, discussions

  • 11h00-11h30 : « Raisonner sur les données pour l’aide à l’innovation en agroécologie » Elie Najm (INRIA), Jean-François Baget (INRIA), Léo Garcia, Christian Gary, Raphaël Métral (Montpellier SupAgro), Marie-Laure Mugnier (INRIA) - Présentation - Vidéo
  • 11h30-12h00 : « AOBRA : Une plateforme de données sémantiques sur le web pour les agroforestiers et leur partenaires » CONDE SALAZAR Raphaël (Université de Montpellier) PrésentationVidéo

12h00-14h00: Pause déjeuner 

14h00-16h45 : Exposés, discussions

  • 14h00-14h30 : « Ontological Formalisation of Mathematical Equations for Phenomic Data Exploitation » Felipe Vargas (INRAE) - Résumé - PrésentationVidéo
  • 14h30-15h00 : « Annotation des Bulletins de Santé du Végétal » Anna Chepaikina (INRAE TSCF) , Robert Bossy (INRAE MAIAGE), Catherine Roussey (INRAE TSCF), Stephan Bernard (INRAE TSCF) - Résumé - Présentation - Vidéo
  • 15h00-15h30 : « Extraction d’instances de relations n-aires issues d’articles scientifiques guidée par une ontologie: comparaison de méthodes structurelles, fréquentistes et sémantiques. » Martin Lentschat (INRAE UMR IATE), Patrice Buche (INRAE UMR IATE), Juliette Dibie-Barthelemy (INRAE MIA Paris) , Luc Menut (INRAE UMR IATE), Mathieu Roche (CIRAD) - Résumé - Présentation - Vidéo

       15h30 – 15h45 pause

  • 15h45-16h15 : « AIC TransformON : Construire une ontologie sur les procédés alimentaires et non alimentaires pour permettre une meilleure interopérabilité des données et des outils développés pour l’intégration de connaissances au sein du Département TRANSFORM » Magalie Weber (INRAE UR BIA), Liliana Ibanescu (AgroParisTech & INRAE MIA Paris), Patrice Buche (INRAE UMR IATE), Stéphane Dervaux (INRAE MIA Paris), Hervé Guillemin INRAE – Plateforme Plastic), Caroline Pénicaud (INRAE UMR SayFood), Elisabeth Guichard (INRAE CSGA), Sophie Aubin (INRAE DipSO) - Résumé - Présentation - Vidéo
  • 16h15-16h45 : « Un modèle sémantique en vue d'améliorer la FAIRisation des données météorologiques » Amina Annane (Université de Toulouse, IRIT), Mouna Kamel (Université de Toulouse, IRIT), Nathalie Aussenac-Gilles, (Université de Toulouse, IRIT) Cássia Trojahn (Université de Toulouse, IRIT), Catherine Comparot (Université de Toulouse, IRIT), Christophe Baehr (Météo-France, CNRM) - RésuméPrésentation - Vidéo

16h45-17h00 : Bilan et fin de la journée