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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2021

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Pérou

Centre International de la Pomme de terre

Pérou
Le CIP est une organisation internationale de recherche agricole. Notre vision est que les racines et les tubercules améliorent la vie des personnes démunies.

Missions

La mission du CIP est de travailler avec des partenaires pour assurer la sécurité alimentaire, le bien-être et l'équité entre les sexes pour les personnes démunies grâce à l'agriculture des racines et des tubercules et les systèmes alimentaires dans les pays en développement. Nous le faisons grâce à la recherche et à l'innovation en sciences, en technologie et en renforcement des capacités.

Nous étudions les virus de la pomme de terre, de la patate douce et d'autres racines et tubercules andines au Pérou et dans le monde entier. Nous menons également des recherches sur la résistance aux virus, sur le flétrissement bactérien de la pomme de terre et sur le mildiou. Nous développons aussi de nouvelles méthodes de diagnostic et des outils de surveillance et d'évaluation des risques.

 Projets actuels:

  • La virome de la pomme de terre au Pérou    
  • Le virome d'autres racines et tubercules andines
  • Outils de diagnostic améliorés pour la détection des virus de la patate douce
  • Nouveaux procédés en phytosanitaire : détection rapide et élimination des virus des racines et des tubercules
  • Amélioration du diagnostic et de la cartographie génotypique / épidémiologique de la maladie du flétrissement bactérien de la pomme de terre en Afrique de l'Est
  • Blocage des communications afin d'améliorer la résistance face au flétrissement bactérien de la pomme de terre
  • Développement de modèles de transmission viraux pour les virus émergents et en vue des prévisions de changements climatiques

Contact                           

Jan Kreuze

 (Responsable de l'équipe)

Jan Kreuze

Email: j.kreuze@cgiar.org

Tel.: +51 1 3496017 ext 3054

Equipe

  • Lima: 2 scientifiques, 1 assistant, 1 technicien, 5 étudiants
  • Kenya: 1 scientifique, 1 étudiant

Compétences

  • Séquençage des petits ARN et assemblage d'ARN
  • LAMP
  • Tube-arrays
  • Ssérologie
  • qRT-PCR
  • Modélisation des risques
  • Diagnostic

Publications sélectionnées

  • Zheng Y, Gao S, Padmanabhan C, Li R, Galvez M, Gutierrez D, Fuentes S, Ling, Kai-Shu; Kreuze J, Fei Z (2016) An automated pipeline for efficient virus discovery using deep sequencing of small RNAs. Virology, pdf
  • Untiveros M, Olspert A, Artola K, Firth AE, Kreuze JF and Valkonen JPT (2016) A novel sweet potato potyvirus ORF is expressed via polymerase slippage and suppresses RNA silencing. Molecular Plant Pathology 17(7):1111-23, DOI: 10.1111/mpp.12366
  • Kyndt T, Quispe D, Zhai H, Jarret RL, Ghislain M, Q-C Liu, Gheysen G, Kreuze JF (2015) The genome of cultivated sweetpotato contains Agrobacterium T-DNAs with expressed genes: an example of a naturally transgenic food crop Proceedings of the National Academy of Sciences USA 112, 18: 5844–5849, doi: 10.1073/pnas.1419685112
  •  Kreuze, J.F., Pérez, A., Untiveros, M., Quispe, D., Fuentes, S., Barker, I., Simon, R. (2009) Complete viral genome sequence and discovery of novel viruses by deep sequencing of small RNAs: a generic method for diagnosis, discovery and sequencing of viruses. Virology 388: 1-7 DOI 10.1016/j.virol.2009.03.024
  • Cuellar, W.J., Kreuze, J.F., Rajamäki, M.L., Cruzado, K.R., Untiveros, M., and Valkonen, J.P.T. (2009) Elimination of antiviral defense by viral RNase III. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 106: 10354-10358 DOI 10.1073/pnas.0806042106