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Equipe Dynamique et Evolution des Parois cellulaires végétales

Responsables : E Jamet & C Dunand

elisabeth.jamet@univ-tlse3.fr, christophe.dunand@univ-tlse3.fr

Laboratoire de Recherche en Sciences végétales

UMR 5546 Université Paul Sabatier-Toulouse 3/CNRS/Toulouse INP

L’équipe Dynamique et Evolution des Parois cellulaires végétales (https://lrsv.cnrs.fr/equipes-de-recherche/dynamique-et-evolution-des-parois-cellulaires-vegetales/) a été l’une des équipes pionnières dans le domaine de la protéomique des parois végétales. De nombreuses améliorations technologiques ont été apportées pour augmenter la couverture des protéomes pariétaux. Différents organes des plantes modèles Arabidopsis thaliana, Brachypodium distachyon et Marchantia polymorpha ont été étudiés ainsi que de la canne à sucre, du tournesol et du blé. Les protéines identifiées ont été systématiquement ré-annotées afin de valider les prédictions de peptide signal et de domaines fonctionnels. Enfin, l’étude des modifications post-traductionnelles de certaines de ces protéines a été entreprise conduisant ainsi à l’étude de pattern d’hydroxylation de proline et à la caractérisation de N- et de O-glycanes. La base de données WallProtDB construite par l’équipe (http://www.polebio.lrsv.ups-tlse.fr/WallProtDB/) répertorie les protéomes pariétaux de plantes dont les génomes sont séquencés et qui ont été publiés depuis le début des années 2000.

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Cell wall proteins and Development team

Group leaders: E Jamet & C Dunand

elisabeth.jamet@univ-tlse3.fr, christophe.dunand@univ-tlse3.fr

Laboratoire de Recherche en Sciences végétales

UMR 5546 Paul Sabatier-Toulouse 3 University/CNRS/Toulouse INP

The Dynamics and Evolution of Plant cell walls team (https://lrsv.cnrs.fr/dynamics-and-evolution-of-plant-cell-walls/) has been a pioneer in the field of cell wall proteomics. Arabidopsis thaliana, Brachypodium distachyon and Marchantia polymorpha have been studied as well as sugarcane, sunflower and wheat. The identified proteins have been systematically re-annotated for the presence of a signal peptide and of functional domains. Finally, the post-translational modifications of these proteins have been studied leading to the characterization of new patterns of prline hydroxylation and of N- and O-glycans.  The WallProtDB database has been built up by the team (http://www.polebio.lrsv.ups-tlse.fr/WallProtDB/) and contains the cell wall proteomes of plants having sequenced genomes published since the beginning of the 2000’s.