EQUIPEMENTS & OFFRES

Accueil
EQUIPEMENTS & OFFRES

EQUIPEMENTS & OFFRES

PHENOTIC rassemble des outils de croissance en conditions contrôlées et de phénotypage basés essentiellement sur l’acquisition et le traitement d’images conventionnelle et non conventionnelle. La plate-forme propose un accès à des équipements permettant d'effectuer le phénotypage de la semence à la plante entière. Les équipements et les offres accessibles sur la plate-forme en 2024 sont recensés ci-dessous.

Angers PLANT Phenotyping Facility : phénotypage plante entière

Capture d’écran 2023-01-20 à 11.31.55

• Phénotypage des interactions hôte-pathogène

POUR QUI ?

  • Laboratoires de recherche, académiques ou privés, semenciers,... 

POUR QUOI ?

  • Sélection de plantes résistantes aux bio-agresseurs
  • Comparaison de l’agressivité de souches de pathogènes

COMMENT ?

  • Quantification précise et objective des symptômes de maladies sur feuille
  • Etude de l’agression d’espèces potagères par des bactéries, champignons, plantes parasites
  • L’analyse automatisée d’images de plantes cibles de bio agresseurs et la mise en forme de résultats de phénotypage (phenoplant.org) :
    • L’identification de paramètres de fluorescence de chlorophylle intéressants pour la quantification d’un stress
    • La classification des images (identification d’échantillons anormaux, …)
    • La segmentation automatisée des symptômes
    • La quantification de la sévérité des symptômes et comparaison de la sensibilité des variétés

Les équipements sont adaptés pour l’imagerie des interactions plantes/pathogènes (jusqu’à 500 plantes / jour) avec des systèmes d’imagerie de fluorescence de chlorophylle, d’imagerie de thermographie dans la bande II et d’imagerie hyper-spectrale (400 à 1000 nm) ainsi qu’un ensemble de caméras RGB (visible).

Ressources imagerie

• Architecture et développement 3D

POUR QUI ?

  • Laboratoires de recherche, académiques ou privés, horticulteurs, paysagistes,... 

POUR QUOI ?

  • Identification de descripteurs morphométriques en relation avec l’esthétique des plantes
  • Evaluation de l’impact de facteurs de l’environnement (biotiques et abiotiques) sur l’architecture de buissons

COMMENT ?

  • Mesures dans l’espace des paramètres caractérisant l’architecture d’un buisson d’ornement :
    • Longueur
    • Redressement
    • Allongement
    • Fléchissement
  • Développement 3D des plantes :
    • Mesures dans l’espace
    • Reconstitution 3D
    • Simulation de développement 3D

Des laboratoires équipés d'outils d'imagerie dédiés aux phénotypage des interactions plantes/pathogène et architecture des plantes entières sont disponible sur la plate-forme en zone sans et avec confinement. Ces laboratoires sont hébergés au seins de l'infrastructure de recherche scientifique Angers Plant Phenotyping Facilitie constitué de 59 module de serres allant de 25m² à 400m² et 22 salles de culture de 10m² couvrant une surface d'environ 7000 m² incluant des espaces de  confinements S2 et S3, mais aussi de deux serres semi fermées de 300m2 chacune permettant la culture de plantes herbacées et ligneuses en conditions contrôlées. Ces installations offrent le potentiel pour cultiver un large éventail de plantes; les expérimenter ou inoculer dans des conditions contrôlées, la plateforme offre aussi la possibilité de manipuler des Organismes Génétiquement modifiés et des Organismes Nuisible de Quarantaine grâce à sa zone de confinement (en accord avec l'agrément adéquat). Toutes ces installations sont situé sur le site de l'IRHS (Beaucouzé - Maine et Loire (49) - France).

Capture d’écran 2023-01-20 à 11.27.24

Angers SEED Phenotyping Facility : phénotypage semence

Capture d’écran 2023-01-20 à 11.31.43

Centrée sur les semences et plantules, elle vise à obtenir des paramètres phénotypiques caractérisant la qualité des semences.

POUR QUI ?

  • Semenciers, laboratoires de recherche

POUR QUOI ?

  • Sélection variétale : caractérisation des espèces et de la diversité génétique
  • Evaluation de la vigueur de lots de semences
  • Etude du déterminisme génétique (QTL)
  • Paramétrage de modèle prévision levée

COMMENT ?

  • Mesure de différents paramètres de germination
    • Vitesse
    • Taux de germination
    • Détermination de l’homogénéité des lots
  • Analyse de la qualité des graines
    • Morphologie et structure interne des semences
    • Croissance des organes lors de la levée
  • Etude de la maturité des semences
    • Analyse du contenu chlorophyllien

• Espèces phénotypées

Espèces d’intérêt agronomique et espèces modèles

  • Laitue
  • Haricot
  • Chou
  • Concombre
  • Tomate
  • Pois
  • Oignon
  • Carotte
  • Betterave
  • Arabidopsis thaliana
  • Colza
  • Tournesol
  • Medicago truncatula
  • Luzerne
  • Maïs
  • Blé

Un ensemble d'une dizaine de laboratoires (environ 20 m² chacun) d'une surface totale d'environ 200 m² sont équipés des outils d'imagerie dédiés au phénotypage des semences et plantules. Ces laboratoires sont hébergés dans les locaux de la SNES-GEVES.

Les équipements dont dispose la plate-forme sont adaptés pour :
- l’imagerie de la germination avec 5 multicams (1600 semences par multicam) et 1 arabanc (jusqu’à 500 semences d’Arabidopsis)
- l’imagerie de l’allongement de plantules avec 1 eloncam (jusqu’à 800 plantules)
- l’imagerie RX (3D et 2D) pour l’analyse structurale de semences sèches

Pour plus d'infos >>>   https://www.geves.fr/

Date de modification : 26 janvier 2024 | Date de création : 16 avril 2018 | Rédaction : PHENOTIC