PathoFood est un projet de recherche sur 5 ans (2018-2023) financé par l’ANR dans le cadre de l’Appel à Projet Générique 2017 : Alimentation et systèmes alimentaires, Défi 5 : Sécurité alimentaire et défi démographique, Axe 1 : Socle de connaissance pour répondre aux enjeux du défi.

Le projet PathoFood vise à décrypter l’hétérogénéité cellulaire et la distribution spatiale de bactéries pathogènes dans des matrices alimentaires en interaction avec les communautés microbiennes des aliments. L’objectif est de mieux comprendre comment l’hétérogénéité physiologique des populations de bactéries pathogènes influence leur implantation dans des matrices alimentaires, où différents microenvironnements, qui se distinguent par leurs propriétés physico-chimiques, biochimiques et leurs microbiotes endogènes, coexistent. Ce projet est ciblé sur la caractérisation de deux bactéries pathogènes d'origine alimentaire qui contaminent généralement les aliments à des niveaux initiaux très bas (de l’ordre de 100 bactéries par gramme de produit) : Escherichia coli O157:H7 et Listeria monocytogenes. Ces deux pathogènes ne sont impliqués que dans quelques cas d'infection par an suite à l’ingestion d’aliments contaminés, mais sont responsables de graves séquelles pour les patients à risques tels que les enfants et les personnes âgées ou immunodéprimées. Les produits alimentaires ciblés sont la viande, avec le steak haché de bœuf, et le fromage, avec le fromage à pâte molle, dans lesquels ces deux bactéries peuvent se retrouver. Une meilleure compréhension des interactions de ces bactéries pathogènes avec ces écosystèmes alimentaires va permettre d’élaborer de nouveaux modèles mathématiques pour mieux prédire le comportement de ces pathogènes alimentaires au sein de ces environnements complexes et ainsi d’améliorer la sécurité microbiologique des aliments.

PathoFood a été labellisé par les pôles de compétitivité Valorial & Vitagora