19_Focus_Morabito_NOVAE2022

Art19-ns-RA (2022)

FOCUS SAMBO : Biobanking et extraction automatisée d'ADN de microbiotes

La plateforme Sambo vise à créer une biobanque nationale constituée de plus d’un million d’échantillons intestinaux humains. Elle est le point d’entrée du pipeline de métagénomique quantitative de l’unité MGP

Auteur(s)

Christian MORABITO 1

Résumé

Explorer les milliards de bactéries qui peuplent la flore intestinale - ou microbiote - de l’homme et de l’animal à des fins préventives, thérapeutiques et de nutrition : tel est l’enjeu du centre INRAE MetaGenoPolis (MGP), créé en 2012 et financé par le Programme des Investissements d’Avenir. L’expertise de MGP dans l’analyse du microbiome intestinal et de ses implications en matière de santé et de nutrition est largement reconnue dans la communauté scientifique internationale depuis 2010. MGP propose à ses partenaires d’étudier leurs questions par le biais de deux pipelines : la métagénomique quantitative, qui consiste à analyser et modéliser la diversité et la composition des microbiotes complexes, et la métagénomique fonctionnelle qui recherche des bactéries inconnues en vue de découvrir de nouveaux composés bioactifs. Ces activités s’articulent autour de 4 plateformes technologiques innovantes, dont Sambo.

Mots clés

Biobanking, microbiotes

Date de modification : 28 août 2023 | Date de création : 01 juillet 2022 | Rédaction : Christian MORABITO