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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Cahier des techniques

Le cahier des techniques de l'Inra

Développement d'une core collection pomme de terre

10_Esnault_NOVAE2022
Développement d’une core collection de 48 génotypes, représentative de la diversité génétique d’un panel de 350 variétés tétraploïdes de pomme de terre (Solanum tuberosum L.)

Auteur(s)

Florence ESNAULT1; Roland PELLÉ1; Marie-Pierre CANN1; Marie BOUSSEAU1; Marie-Ange DANTEC1; Catherine SOUCHET1; Marie-Claire KERLAN1; Jean-Eric CHAUVIN1

Résumé

Le développement d’une core collection consiste à sélectionner, au sein d’une collection ayant un effectif plus ou moins important, un petit panel de génotypes qui représente la diversité génétique disponible dans la collection de départ, avec un minimum de redondance. Cette étude présente le développement d’une core collection de 48 génotypes, représentative de la diversité génétique d’un panel de 350 variétés tétraploïdes de pomme de terre (Solanum tuberosum L.). Elle a été établie en utilisant des données de génotypage par marqueurs microsatellites (SSR) et la stratégie M qui maximise la diversité allélique. Cette core collection constitue un panel d’un grand intérêt qui a été exploité jusqu’à présent dans le cadre de deux projets de recherche : d’une part, pour évaluer la possibilité d’exploiter la puce SNP SolCAP pour caractériser les ressources génétiques maintenues au sein du CRB BrACySol, et, d’autre part, pour évaluer la variabilité structurale et morphologique des grains d’amidon de pomme de terre .

Mots clés

Diversité génétique, Solanum tuberosum, marqueur microsatellite.