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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Modèles et simulateurs

Modèle/Simulateur
Caractéristiques principales
PhysioDemoGenetics

Le modèle Physio-Démo-Génétique (dénommé PDG) est un modèle de simulation mécanistique spatialement explicite, basé sur l'individu, couplant (1) un module physiologique simulant les réponses individuelles des arbres à l'environnement (modèle CASTANEA, Dufrêne et al. (2) un module démographique simulant la survie des arbres, la reproduction et la dispersion du pollen et des graines; et (3) un module de génétique quantitative contrôlant l'héritabilité des traits clés de l'histoire de vie (mis en œuvre dans la bibliothèque CAPSIS Genetics, Seinave & Pichot 2004). Le modèle PDG a été utilisé pour étudier les composantes plastiques et génétiques des variations du moment du débourrement le long d'un gradient altitudinal de Fagus sylvatica (le hêtre européen), dans la publication de référence de PDG (Oddou-Muratorio & Davi 2014).


Site Web : http://capsis.cirad.fr/capsis/help_en/physiodemogenetics

Metapop

Metapop est un modèle qui simule l'évolution de populations d'espèces sessiles monoïques. Il reproduit les principaux processus évolutifs (migration, sélection, flux de gènes, flux de graines, mutation etc..) qui accompagnent l’histoire d’une espèce. Le modèle est individu centré, génétiquement et spatialement explicite. Metapop permet de suivre des individus et des populations dans un paysage hétérogène constitué de multiples populations connectés par des flux de gènes. Ce suivi porte essentiellement sur les propriétés corrélées à la valeur adaptative d’un individu (fitness, traits adaptatifs, génotype, valeur génétique).


Pour plus d'information : https://quercusportal.pierroton.inra.fr/metapop/metapop-user-documentation.pdf


Site Web : https://quercusportal.pierroton.inra.fr/index.php?p=METAPOP