En savoir plus

Notre utilisation de cookies

« Cookies » désigne un ensemble d’informations déposées dans le terminal de l’utilisateur lorsque celui-ci navigue sur un site web. Il s’agit d’un fichier contenant notamment un identifiant sous forme de numéro, le nom du serveur qui l’a déposé et éventuellement une date d’expiration. Grâce aux cookies, des informations sur votre visite, notamment votre langue de prédilection et d'autres paramètres, sont enregistrées sur le site web. Cela peut faciliter votre visite suivante sur ce site et renforcer l'utilité de ce dernier pour vous.

Afin d’améliorer votre expérience, nous utilisons des cookies pour conserver certaines informations de connexion et fournir une navigation sûre, collecter des statistiques en vue d’optimiser les fonctionnalités du site. Afin de voir précisément tous les cookies que nous utilisons, nous vous invitons à télécharger « Ghostery », une extension gratuite pour navigateurs permettant de les détecter et, dans certains cas, de les bloquer.

Ghostery est disponible gratuitement à cette adresse : https://www.ghostery.com/fr/products/

Vous pouvez également consulter le site de la CNIL afin d’apprendre à paramétrer votre navigateur pour contrôler les dépôts de cookies sur votre terminal.

S’agissant des cookies publicitaires déposés par des tiers, vous pouvez également vous connecter au site http://www.youronlinechoices.com/fr/controler-ses-cookies/, proposé par les professionnels de la publicité digitale regroupés au sein de l’association européenne EDAA (European Digital Advertising Alliance). Vous pourrez ainsi refuser ou accepter les cookies utilisés par les adhérents de l'EDAA.

Il est par ailleurs possible de s’opposer à certains cookies tiers directement auprès des éditeurs :

Catégorie de cookie

Moyens de désactivation

Cookies analytiques et de performance

Realytics
Google Analytics
Spoteffects
Optimizely

Cookies de ciblage ou publicitaires

DoubleClick
Mediarithmics

Les différents types de cookies pouvant être utilisés sur nos sites internet sont les suivants :

Cookies obligatoires

Cookies fonctionnels

Cookies sociaux et publicitaires

Ces cookies sont nécessaires au bon fonctionnement du site, ils ne peuvent pas être désactivés. Ils nous sont utiles pour vous fournir une connexion sécuritaire et assurer la disponibilité a minima de notre site internet.

Ces cookies nous permettent d’analyser l’utilisation du site afin de pouvoir en mesurer et en améliorer la performance. Ils nous permettent par exemple de conserver vos informations de connexion et d’afficher de façon plus cohérente les différents modules de notre site.

Ces cookies sont utilisés par des agences de publicité (par exemple Google) et par des réseaux sociaux (par exemple LinkedIn et Facebook) et autorisent notamment le partage des pages sur les réseaux sociaux, la publication de commentaires, la diffusion (sur notre site ou non) de publicités adaptées à vos centres d’intérêt.

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit des cookies sessions CAS et PHP et du cookie New Relic pour le monitoring (IP, délais de réponse).

Ces cookies sont supprimés à la fin de la session (déconnexion ou fermeture du navigateur)

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit du cookie XiTi pour la mesure d’audience. La société AT Internet est notre sous-traitant et conserve les informations (IP, date et heure de connexion, durée de connexion, pages consultées) 6 mois.

Sur nos CMS EZPublish, il n’y a pas de cookie de ce type.

Pour obtenir plus d’informations concernant les cookies que nous utilisons, vous pouvez vous adresser au Déléguée Informatique et Libertés de l’INRA par email à cil-dpo@inra.fr ou par courrier à :

INRA
24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

Menu Logo Principal IMABS 2

Pôle Informatique et Mathématiques pour les AgroBioSciences (IMABS)

Séminaire IMABS sur le thème des réseaux en biologie :Vincent FROMION (INRA, MaIAGE, BioSys) et Anne SIEGEL (Univ. Rennes, Inria, CNRS, IRISA)

Séminaire transmis par visio-conférence pour les personnels du site de Saint-Martin

Séminaire IMABS sur le thème des réseaux en biologie : Vincent FROMION et Anne SIEGEL
Le vendredi 17 mai 2019, Vincent Fromion (INRA, MaIAGE, BioSys) et Anne Siegel (Univ Rennes, Inria, CNRS, IRISA, Dyliss team), interviendront dans le cadre d'un double séminaire sir le thème des réseaux en biologie. Une collation d'accueil sera proposée aux participants, dans le hall d'entrée de l'Accueil du Centre Inra, à 10h00 (devant la salle Marc Ridet).

Programme :

10h00 - 10h45Vincent FROMION (Inra, MaIAGE, BioSys, Université Paris-Saclay)                        

 La modélisation systémique de la cellule constitue-t-elle une base utile de la représentation des liens entre les entités de la cellule à travers des « graphes » ?

Résumé. Avant d’aborder à proprement parler la question de l’utilisation des graphes dans cet exposé, j’insisterai sur le fait que cette question s’inscrit plus largement dans un cadre de la modélisation des systèmes vivants et des « moyens/méthodes » qu’il s’agit de déployer pour exploiter de façon efficace les données, les informations et les connaissances qui sont à notre disposition. Cela conduira à insister sur la nécessité actuelle de progresser dans la représentation (formelle) des systèmes vivants afin en autres de faciliter la mise en œuvre des méthodes développées par les statisticiens ou les « apprentistes ».

Dans la partie principale de l’exposé, en revisitant la question de l’inférence des réseaux de régulation (ici en me restreignant au cas de la bactérie), j’illustrerai en quoi la modélisation peut aider à définir « la nature des graphes » qu’il faudrait considérer afin par exemple d’intégrer des données de nature différentes de transcritpomique, protéomique, métabolique, etc. voire les NGS (chip-seq, ribosome profiling, etc.        

10h45 - 11h05Pause                                                                                 
11h05 - 11h50Anne SIEGEL (Univ Rennes, Inria, CNRS, IRISA Dyliss team)

Reasoning-based systems for the study of large-scale metabolic networks and microbiomes.

Résumé. Systems modeled in the context of molecular and cellular biology are highly difficult to model in a unique way. In this context, we will describe how several approaches based on reasoning allow the systems to be identified, validated, improved and finally studied despite lacks of data. To that goal, we rely on Answer Set Programming, a paradigm of logical programming. We will illustrate this approach on the reconstruction and study of genome-scale metabolic network with an application to the reduction of microbiomes according to expected metabolic phenotypes.

 

Voir aussi

Image: Par Laurens van Lieshout – Travail personnel Domaine public, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=2032585