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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Café numérique : LINDA, outil de gestion des métadonnées de phénotypage des plantes

25/09/2023 - 16 h-17 h - Visioconférence

Café numérique
© Adobe Stock
Le prochain aura lieu lundi 25 septembre à 16h avec une présentation de l’application web LINDA. L’application web Linda, propose un outil complet de saisie et gestion des métadonnées associées à une expérimentation de phénotypage sur les plantes.

LINDA permet ainsi de décrire de façon intuitive les informations telles que par exemple le design expérimental, les protocoles de croissance, les mesures environnementales etc. LINDA est couplée avec une base de données qui stocke ces informations de façon pérenne. Cette base de données utilise les ontologies de référence (e.g., Plant Ontology, Crop Ontology, etc.) et des normes dédiées à ce type d’expériences telles que la norme Minimal Information About Plant Phenotyping Experiment (MIAPPE). Le partage de données est facilité par le respect des principes FAIR (Findable Accessible Interoperable Reusable) comme la possibilité d’exporter ces métadonnées relatives à l’expérimentation dans les formats tabulés ou alors formatés pour la soumission dans les bases de données internationales (ISA-tab).

Intervenant : Benjamin Dartigues, CNRS - Bordeaux

Url : https://bbb.visio.inrae.fr/b/syl-pir-hec-s7z

Email : Cafe-Numerique@inrae.fr