Illustration IA en science du vivant 2

L'IA en sciences du vivant

L'IA en sciences du vivant

Vous ne savez pas ce qu’est l’IA et vous vous demandez si elle peut vous aider à répondre à votre question biologique ?
Vous développez des approches d’IA et êtes à la recherche de cas concrets pour les éprouver ?
DIGIT-BIO vous invite à suivre son cycle d'animations l'IA en Sciences du Vivant : l'ensemble des séances 2023/2023 sont disponibles en replay.

Ouvert aux biologistes et aux méthodologistes, ce cycle de séminaires et webinaires propose un apprentissage commun, pour :

  • partager un vocabulaire et des méthodologies d’IA ;
  • sensibiliser aux applications d’IA propres aux sciences du vivant ;
  • identifier des questions biologiques pour lesquelles des développements en IA méritent d’être poursuivis ;

Le format des animations propose un cours pour explorer une méthodologie d'IA, suivie d'une étude de cas présentée par un binôme biologiste/ méthodologiste.

En savoir plus ? Contacter la cellule d'animation DIGIT-BIO IA  :  Julien Chiquet, Marie-Laure Martin et Christèle Robert Granié

L'ensemble des séances 2022-2023 sont disponibles en replay :

  • séance 0 : Introduction au Machine Learning (Liva Ravaivola)
     
  • séance 1 : Machine Learning pour la classification supervisée
    Cours : Comment faire des prédictions à partir de vos données biologiques grâce au Machine Learning ? De la régression logistique aux réseaux de neurones - Blaise Hanczar
    Étude de cas : Explorer le paysage cellulaire avec le Deep Learning - Emmanuel Moebel, Fadwa Fatmaoui
     
  • séance 2 : Identification de structure par classification non-supervisée
    Cours : Comment trouver des structures dans vos données biologiques avec la classification non supervisée ? Méthodes de distance, modèles de mélange ou réseaux de neurones - Cathy Maugis Rabusseau
    Étude de cas : Comprendre les interactions et l'organisation des réseaux écologiques grâce à l’analyse de réseaux - Apprentissage non supervisé de structures de graphes - Sophie Donnet, François Massol
     
  • séance 3 : Identification de structure par réduction de dimension
    Cours :
    De l’analyse en composantes principales aux auto-encodeurs variationnels - Stéphanie Allassonnière
    Étude de cas : Quelle est la dimension pertinente de l’espace d’expression des gènes? -  Olivier Gandrillon Franck Picard
     
  • Séance 4 : Traitement automatique des langues
    Cours :
    Comment extraire automatiquement des informations de documents textuels ?  - Arnaud Ferre (Inrae - MaiAge)
    Étude de cas : Mise en pratique de l'Extraction d'Informations dans le domaine de la biodiversité microbienne - Robert Bossy (Inrae - MaiAge)

Voir aussi

DIGIT-BIO lance un nouveau cycle d'animations en 2023 : L'IA en sciences du vivant, la parole aux jeunes scientifiques : https://digitbio.hub.inrae.fr/animations/l-ia-en-sciences-du-vivant-la-parole-aux-jeunes-scientifiques

Dans ce dossier

Illustration IA en science du vivant 2
Ce premier webinaire a été suivi par 276 participants, rassemblant biologistes, modélisateurs et méthodologistes intéressés par la question de l'IA et ses applications en sciences du vivant.
Illustration IA en science du vivant 2
Cette seconde séance organisée en format hybride a été suivie par plus de 200 participants.
Illustration IA en science du vivant 2
Dans cette 2ème séance du cycle l'IA en sciences du vivant, nous vous proposons d'explorer la classification non supervisée. Animée par Cathy Maugis Rabusseau (INSA de Toulouse), Sophie Donnet (INRAE) et François Massol (CNRS), ce cours a été suivi par près de 130 participants. Le replay est ligne pour ceux qui n'ont pas pu y assister.
Illustration IA en science du vivant 2
Cette 3ème séance du cycle l'IA en sciences du vivant, qui s'est déroulée le 27 juin a été animée par Stéphanie Allassonnière (U.Paris), suivie d'une étude de cas en binôme présentée par Olivier Gandrillon et Franck Picard (CNRS). Les vidéos et présentations sont en ligne.
Illustration IA en science du vivant 2
Cette 4ème séance du cycle "L'IA en sciences du vivant" a été dédiée au traitement automatique des langues, avec un cours animé par Arnaud Ferré (INRAE, MaIAGE) suivi d'une étude de cas présentée par Robert Bossy (INRAE, MaIAGE)

Date de modification : 02 novembre 2023 | Date de création : 10 janvier 2022 | Rédaction : Com