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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Thonon Culture Collection TCC du Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et les Ecosystèmes Limniques

Actualités

Phytool
© Alexis Canino & INRAE
June 2022: Phytool: a taxonomy tool and a DNA barcodes reference library for microalgae - developped by A. Canino (ECLA project)
  • June 2022: Phytool: a taxonomy tool and a DNA barcodes reference library for microalgae - developped by A. Canino (ECLA project)
  • July 2021: protocols for diatom metabarcoding are available here : https://www6.inrae.fr/carrtel-collection/Barcoding-database
  • December 2020: A logo for Diat.barcode reference library was design by Mihail Zhelyazkov. It was selected among several by the Diat.barcode experts ! Thanks a lot Mihail: https://mihonz.myportfolio.com/
  • July 2020: new environmental samples gathered in the TCC including species such as Achnanthidium subhudsonis, A. subatomus, A. druartii.
  • Jun 2020: new version of Diat.barcode: Diat.barcode v8
  • March 2019: ready to use barcoding libraries for metabarcoding pipelines here (Mothur, DADA2)
  • Feb 2019: Diat.barcode a reference barcoding library for diatoms is now online here 
  • Juillet 2018 : la TCC a son DOI : Rimet, Frédéric; Chardon, Cécile; Lainé, Leslie; Bouchez, Agnès; Domaizon, Isabelle; Guillard, Jean; Jacquet, Stéphan, 2018, "Thonon Culture Collection -TCC- a freshwater microalgae collection", https://doi.org/10.15454/UQEMVW, Portail Data Inra, V1
  • 2018 : La TCC  fait parti du BRC4Env, le réseau des Centres de Ressources Biologiques pour l'Environnement. Il a pour but de stocker et fournir des ressources environnementales (matériel biologique et données associées), de manière sécurisée et avec une traçabilité optimale. Le BRC4Env est l'un des piliers de l'infrastructure nationale française "Ressources Agronomique pour la Recherche" (AgroBRC-RARe). La présentation du BRC4Env est publiée: Mougin, C., Artige, E., Marchand, F., Mondy, S., Ratié, C., Sellier, N., Castagnone, P., Coeur D'Acier, A., Esmenjaud, D., Faivre-Primot, C., Granjon, L., Hamelet, V., Lange, F., Pages, S., Rimet, F., Ris, N., Salle, G. (2018). BRC4Env, a network of Biological Resource Centres for research in environmental and agricultural sciences. Environmental Science and Pollution Research. DOI : 10.1007/s11356-018-1973-7    https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11356-018-1973-7
  • 21 juin 2017 : Evaluer l’état écologique des cours d’eau en séquençant l’ADN des diatomées
  • Juin 2017 : plus d'une 10aine de nouvelles espèces de France métropolitaine barcodées et ajoutées à la collection
  • Mai 2016 : nouvelles espèces tropicales de Mayotte intégrées à la collection
  • 25 Mars 2015 : meilleure thèse européenne : Xu Zhong, en cadré par Stéphan Jacquet (UMR CARRTEL)
    "Freshwater dsDNA viral diversity: a special emphasis on viruses infecting phytoplankton (cyanophage and phycodnaviruses) and T4-like myophages in peri-alpine lakes."
    De nombreuses cultures de picocyanobactéries de la TCC ont été utilisé dans le cadre de sa thèse ! Félicitation à Xu Zhong !
  • Mars 2015 : nouvelles cultures de diatomées des Alpes Italiennes et Françaises
  • Janvier 2014 : de nouveaux séquençages de diatomées de sols et de rivières de Suède ; une 50aine de nouvelles cultures ont été isolées et séquencées.
  • Début 2013 : de nouvelles cultures de diatomées des milieux Alpins vont entrer dans la collection
  • Ete 2012 : des nouvelles cultures de picocyanobactéries rentrent dans la TCC
  • Juin 2012 : projet phylogenie et écologie des diatomées
  • Janvier 2012 : 3 cultures de Zygnematophyceae et 2 cultures d'Ulvophyceae entrent dans la TCC (glaciers proches du Mont-Blanc).
  • Novembre 2011 : 22 cultures de picocyanobactéries entrent dans la TCC (lacs d'Annecy et Bourget).
  • Été 2011 : séquençage de 300 cultures de diatomées.
  • Décembre 2010 : 28 cultures de diatomées entrent dans la TCC (Lac de Genève).
TCC-840 Encyonema caespitosum
SNAP-140416-0023
Pinnularia

Pinnularia