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Cahier des techniques

Le cahier des techniques de l'Inra

Chapitre 3

Chap 3
Phénotypage

Les articles sont accessibles au format pdf ci-dessous

L’entomologie appliquée à la protection des cultures n’échappe pas aux grandes orientations de la recherche et se retrouve à ce titre confrontée à la question de l’optimisation des méthodes de phénotypage. L’activité de phénotypage est en effet centrale pour de très nombreuses thématiques comme, par exemple (i) la reconnaissance en routine d’individus, (ii) la compréhension des comportements individuels et des processus populationnels qui en découlent (établissement local et dispersion), (iii) la réponse des insectes étudiés à des xénobiotiques ou à d’autres espèces, (iv) l’évaluation d’espèces utiles voire leur amélioration génétique. On commence ainsi à imaginer des systèmes ou des outils pour s’élancer dans le champ du phénotypage à haut-débit.
La section « Phénotypage » de ce numéro spécial présente six articles, montrant des exemples très diversifiés de phénotypage. La SPIR (Siegwart et al.) permettant d’identifier des larves rapidement et sans destruction, le moulin de vol (Chipeaux et Vétillard) pour évaluer automatiquement les capacités de dispersion, l’analyse d’images (Perez et al.) pour étudier les choix de ponte ou le déplacement des trichogrammes, ou bien les puces RFID (Aupinel et al.), sont des outils qui favorisent les études de grands nombres d’insectes y compris dans leur environnement naturel. Enfin, le dispositif de caractérisation simultanée du développement de la plante en lien avec son ravageur (Rousselin et al.), ou le dispositif d’évaluation du niveau de résistance de larves de papillon aux insecticides (Maugin et Siegwart) permettent de mieux caractériser les interactions de l’insecte avec son environnement. Dans la plupart des cas, les innovations techn(olog)iques semblent issues des équipes de recherche elles-mêmes mais on peut toutefois mentionner l’implication du CATI DIISCO : Développements Informatiques pour l’Instrumentation. Dans le cadre de la transition souhaitée vers le phénotypage haut-débit, nul doute que de tels besoins en Informatique, Electronique mais également en Imagerie et Automatisme se feront de plus en plus pressants et des réflexions/ initiatives collectives à ce sujet semblent particulièrement opportunes.

Documents à télécharger

Art 12

Utilisation de puces RFID pour le suivi des abeilles

La miniaturisation des tags transpondeurs RFID (radio frequency identification) permet le marquage d’organismes de plus en plus petits, tels que...
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Art 13

Mesures de vol chez Monochamus galloprovinciallis : construction d’un manège de vol (flight mill) et automatisation de la récolte de données

Afin d’évaluer la capacité de dispersion du longicorne xylophage Monochamus galloprinvicialis, responsable de la dissémination du nématode du...
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Art 14

Test d’évaluation des résistances de populations sauvages de carpocapse des pommes (Cydia pomonella) aux insecticides

Afin de pouvoir estimer précisément le niveau de résistance aux insecticides de populations sauvages de carpocapses de la pomme, Cydia pomonella,...
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Art 15

Une méthode d'analyse d'image automatique pour quantifier rapidement les nombres d'œufs et les taux de parasitisme chez Trichogramma sp.

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Art 16

Dispositif de caractérisation simultanée de l’abondance de pucerons et de la croissance végétative d’arbres fruitiers

Afin de comprendre les interactions entre pratiques culturales, croissance des plantes et dynamique d’insectes ravageurs, le laboratoire «Plantes...
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Art 17

La spectroscopie proche infra-rouge pour le phénotypage d’insectes

La détermination d’insectes est une discipline complexe, les quelques experts en mesure d’identifier tous les insectes ravageurs de façon...
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