Les objectifs :

I- Développement de techniques de détection innovantes (PCR microfluidiques en temps réel notamment) pour mieux caractériser les agents pathogènes transmis par les tiques ou d'autres arthropodes vecteurs.

Technique de détection à haut débit des agents pathogènes vectorisés, basé sur des PCR microfluidiques en temps réel (Fluidigm, USA)

II- Etude de la compétence vectorielle des tiques vis-à-vis de différents agents pathogènes (bactéries, parasites et virus).

III- Etude des coinfections chez les tiques et leurs hôtes mammifères via le développement de modèles de coinfection chez la tique et la souris, en utilisant les agents pathogènes suivants : Borrelia afzelii, Anaplasma phagocytophilum, le virus de l’encéphalite à tiques. Cet objectif fait partie d’un projet collaboratif coordonné par l’équipe MiTick et financé par le Labex Ibeid (2021-2024). 

Techniques disponibles pour l’infection des tiques et l’évaluation de la compétence vectorielle

IV- Développement de techniques (morphométrie géométrique, exploitation des spots sur la face ventrale) pour identifier les différentes espèces de tiques.

Technique de morphométrie géométrique pour l’identification des espèces de tiques

Résultats majeurs :

I- Développement d’outils à haut débit basés sur des PCR microfluidiques en temps réel permettant la détection de 65 bactéries, 28 parasites, 53 virus transmis par les tiques et 206 virus transmis par les moustiques, lors d’études épidémiologiques :

Nombreuses collaborations nationales et internationales sur le sujet.

• Publications qui détaillent les techniques développées :

High-throughput screening of tick-borne pathogens in Europe, 2014, Michelet et al. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

Prevalence of tick-borne viruses in Ixodes ricinus assessed by high-throughput real-time PCR, 2018, Gondard et al. Pathogens and Disease

A New High-Throughput Tool to Screen Mosquito-Borne Viruses in Zika Virus Endemic/Epidemic Areas, 2019, Moutailler et al. Viruses

Upscaling the Surveillance of Tick-borne Pathogens in the French Caribbean Islands, 2020, Gondard et al. Pathogens

• Publications utilisant la technique :

High Diversity, Prevalence, and Co-infection Rates of Tick-Borne Pathogens in Ticks and Wildlife Hosts in an Urban Area in Romania, 2021, Borsan et al. Front. Microbiol. 

Atelerix algirus, the North African Hedgehog: Suitable Wild Host for Infected Ticks and Fleas and Reservoir of Vector-Borne Pathogens in Tunisia, 2021, Balti et al. Pathogens

Clinical Aspects and Detection of Emerging Rickettsial Pathogens: A "One Health" Approach Study in Serbia, 2020, 2022, Banovic et al. Front Microbiol.

II- Etude de la compétence vectorielle de différentes espèces d’Ixodes et différentes populations d’Ixodes ricinus vis-à-vis du virus Kemerovo et virus de l’encéphalite à tiques :

Evaluation of two artificial infection methods of live ticks as tools for studying interactions between tick-borne viruses and their tick vectors, 2022, Migné et al. Scientific Reports

Evaluation of Vector Competence of Ixodes Ticks for Kemerovo Virus, 2022, Migné et al. Viruses

III- Etude des spots alaires chez des espèces proches de Culicoides comme outil de diagnostic :

An Android App to Classify Culicoides Pusillus and Obsoletus Species, 2021, Gutiérrez et al. Applications of Computational Intelligence 

An approach to automatic classification of Culicoides species by learning the wing morphology, 2020, Venegas et al. PlosOne 

MosCla app: An android app to classify Culicoides species, 2020, Gutiérrez et al. IEEE Xplore

Geometrical Characterization of Dipterans’ Wings Towards Automatic Mosquito Identification, 2019, Benalcazar et al. IEEE Xplore

Image processing algorithm for improving the identification of patterns on Diptera wings, 2016, Benitez et al. IEEE Xplore

IV- Développement de la morphométrie géométrie chez des espèces affines de culicoïdes :

Wing geometry as a tool for discrimination of Obsoletus group (Diptera: Ceratopogonidae: Culicoides) in France, 2014, Hadj-Henni et al. Inf. Gen. Evol. 

Taxonomic assessment of Culicoides brunnicans, C. santonicus and C. vexans (Diptera: Ceratopogonidae) in France: Implications in systematics, 2015, Hadj-Henni et al.  Inf. Gen. Evol. 

Comprehensive characterisation of Culicoides clastrieri and C. festivipennis (Diptera: Ceratopogonidae) according to morphological and morphometric characters using a multivariate approach and DNA barcode, 2021, Hadj-Henni et al. Scientific Reports

Projets actuels :

• Coinfections : New insights regarding tick co-infection ? (2021-2024). Coordinateur : Equipe MiTick
• Microfluidic : Collaborations nationales et internationales sur la détection par PCR microfluidiques des agents pathogènes transmis par les arthropodes (depuis 2014). Coordinateur : S Moutailler
• Morphométrie-géométrique : Développement de l’outil (depuis 2021). Coordinateur : Denis Augot

Collaborations :

• National :

- ANSES (UMR Virologie, EPI, Nancy)

- INRAE (Oniris, Theix, Corte)

- CIRAD (Montpellier)

- Institut Pasteur (Paris)

- Université de Corte

• International :

- Réseau international des Instituts Pasteurs : Tunisie, Maroc, Algérie, Iran, Liban, Sénégal, Cambodge, Gabon, Côte d’Ivoire, Guyane, Guadeloupe

- National Veterinary Institute (SVA) : Suède 

- Technical University of Denmark (DTU) et Statens Serum Institut (SSI) : Danemark 

- Animal and Plant Health Agency (APHA) : Royaume Uni

- Wageningen University & Research (WUR) et National Institute for Public Health and the Environment (RIVM) : Pays Bas 

- Friedrich-Loeffler-Institute (FLI) : Allemagne 

- Biological Center SAS/Institut of Parasitology : République Tchèque