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La crise sanitaire de Covid19 a révélé l'importance des connaissances sur la biodiversité des coronavirus. Ces derniers mois, l'attention s'est majoritairement concentrée sur les chauves-souris, comme principaux réservoirs de coronavirus de la faune sauvage. Cependant, il ne faut pas négliger l'importance des rongeurs comme autre groupe majeur de réservoirs potentiels d'agents zoonotiques, dont les coronavirus, susceptibles d'être transmis à l'humain. En effet,

- Les rongeurs sont un ordre très diversifié (parmi les 6500 espèces de mammifères connues, >2500 sont des rongeurs tandis que 1400 sont des chiroptères)

- Le nombre absolu de virus portés par les rongeurs est supérieur à celui des virus portés par les chiroptères

- Certaines espèces de rongeurs peuvent être présentes dans un large éventail d'environnements, des habitats sauvages aux habitats commensaux. Ces espèces généralistes peuvent donc jouer le rôle d' "hôtes-ponts", c'est-à-dire qu'elles peuvent constituer un maillon d'une chaîne de transmission inter-espèces qui permettrait la transmission d'agents pathogènes de la faune sauvage à l'humain

- Les contacts entre les rongeurs et l'humain sont très fréquents, en raison de leur grande abondance dans les agro-écosystèmes et les villes, de leur capacité à vivre à proximité de l'humain, à la fois comme nuisibles et comme animaux de compagnie, et de leur consommation, par exemple en Afrique et en Asie

- Plusieurs espèces de rongeurs figurent dans le top 100 des espèces invasives, ce qui font d'elles de parfaits propagateurs d'agents pathogènes dans le monde entier

- Certains coronavirus humains ont pour origine des coronavirus associés aux rongeurs

Le projet BioRodDis-Covid19 vise à étudier le risque d'émergence de coronavirus et ses liens avec la biodiversité dans tous les sites suivis dans BioRodDis (forêts et parcs urbains). En plus des échantillons de rongeurs, du guano de chauves-souris sera également collecté en 2021, de mai à septembre, afin d'étudier les variations saisonnières de la prévalence des coronavirus chez les chauves-souris.