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Dernière mise à jour : Mai 2018

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LabEx BASC

Facteurs anthropiques et conséquences des flux de gènes cultivés-sauvages chez la pomme

Découvrez les résultats du projet PomFlux. Financé dans le cadre de l'Appel à projet Blanc 2014 et du projet phare 2 "Comprendre et améliorer les capacités adaptatives des agroécosystèmes par la connaissance de la génétique et de l'évolution", le projet PomFlux s'est déroulé sur 2 ans (2015-2016).

Porteur du projet : Tatiana GIRAUD (ESE)

PomFlux journée BASC 2015

Partenaires

  • Équipes BASC : GQE-Le Moulon
  • Équipes extérieures : IRSTEA
  • Partenaires non académiques : Association Française d’Agroforesterie (AFAF)

Contexte et objectif

Ce projet visait à soutenir une collaboration entre les laboratoires ESE et Moulon, et des partenaires non académiques, pour

  1. comprendre les facteurs anthropiques qui influencent les probabilités de flux de gènes du pommier cultivé Malus domestica vers le pommier sauvage M. sylvestris (notamment la fragmentation du paysage, le nombre ou la surface des vergers, ou les changements de pollinisateurs),
  2. déterminer quelles régions génomiques sont concernées par ces flux de gènes (notamment régions codantes ou non, contenant des gènes particuliers) et si elles ont un impact sur l’adaptation (en regardant si les régions génomiques montrent des signatures de sélection et en réalisant des tests de valeurs sélectives),
  3. déterminer si les plants de pommiers sauvages vendus en pépinières sont des hybrides et recommander des pratiques de conservation et reforestation du pommier sauvage en agroforesterie.

Ce projet visait aussi à acquérir des données préliminaires pour le dépôt de projets ANR et européens.

Résultats

Le projet a permis:

  1. d’évaluer la diversité génétique et la structuration des populations françaises de pommiers sauvages, en révélant l’existence de groupes génétiques différents en France
  2. de révéler de forts niveaux d’introgression (c’est-à-dire d’incorporation de matériel génétique par hybridation) du pommier sauvage par le pommier cultivé ; 
  3. de montrer que cette « pollution génétique » dépend du degré d’anthropisation de la région et de l’intensité de la culture du pommier; 
  4. d’identifier des populations « pures » de pommiers sauvages, non introgressées par le pommier domestique, et provenant des différents grands groupes génétiques existant en France, pour établir des vergers conservatoires de pommiers sauvages, qui puissent servir à la réintroduction d’arbres dans les écosystèmes forestiers et agroforestiers ; 
  5. de montrer que les filières de réimplantation des pommiers sauvages ne fournissent au mieux que des hybrides ; 
  6. des vergers conservatoires sont en cours de construction.
  7. de promulguer un Arrêté ministériel réglementant la réimplantation de pommier sauvages pour éviter de réintroduire des individus hybrides
Arrêté relatif à la commercialisation des matériels forestiers de reproduction

Extrait de l'Arrêté du 3 novembre 2015

Publications (non exhaustif)

> Cornille A., Feurtey A, Gélin U, Misvanderbrugge K., Gladieux P, Ropars J, Giraud T. 2015. Anthropogenic and natural drivers of gene flow in a temperate wild fruit tree: a basis for conservation and breeding programs in apples. Evol App. 8: 373–384 (article relayé dans une brève de l’INEE et dans BioFutur) ;

> Feurtey A, Cornille A, Snirc A, Shykoff J, Giraud T. 2016 Crop-to-wild gene flow and its fitness consequences on a wild fruit tree: towards a comprehensive conservation strategy of the wild apple in Europe. Evol App. 10 (2), 180-188.

Vulgarisation

PomFlux - Forêt entreprise

Articles de vulgarisation

> Giraud T et Branca A (2015) Quand l'homme perfectionne les espèces végétales. Les échos.

> Feurtey A. Domestication, une révolution à l’origine de la civilisation : Découverte n°402, janvier-février 2016

<=== Giraud H, Cornille A, Giraud T 2016. Pommiers sauvage et cultivé : ce que la génétique nous apprend de leurs liens passés et présents sur leurs conservation et réimplantation futures ; Forêt Entreprise 229:26-29

Autres éléments de vulgarisation

> Dépliant pour le Salon de l’agriculture avec Cervia 2013

> Intervention à la Maison des Sciences de Chatenay-Malabry

> Intervention à la Fête de la Science 2013 devant des classes de lycée agricole; intervention au lycée agricole d’Igny devant des classes de première en 2015

> Intervention à la Fête de la Science 2015 devant des classes de lycée général; Intervention par visioconférence au lycée Anna Judic de Semur en Auxois (Côte d’Or) devant une classe de Terminale Scientifique; Conférence de vulgarisation : « La domestication » Association Chercheurs Toujours, Paris Institut CurieIntervention devant des classes de Terminale Scientifique du lycée de Saint Cloud en mai 2015 

PomFlux - Graines de Mane

> Mise en place d’un TD de Terminale Scientifique répondant au programme de l’Education Nationale et similaire aux épreuves du Bac avec un enseignant de Fontenay-sous-Bois (M. Farina) et ayant été transmis au rectorat.

> Intervention devant une classe de primaire (CE2) de Chatenay Malabry en 2015

> A la recherche des pommiers sauvages, Graines de Mane, site internet de vulgarisation en agriculture (19/02/2017) ===>

Voir aussi

  • Comprendre et améliorer les capacités adaptatives des agroécosystèmes par la connaissance de la génétique et de l'évolution - Projet phare 2 (2013-2016
  • Impact de la domestication sur l’adaptation d’insectes ravageurs suceurs‐piqueurs chez les arbres fruitiers : vers une lutte biologique contre les pucerons chez les pommiers ? PomPuceDom (2017-2018)
  • Mise en place d'un pré-verger conservatoire d'espèces de plantes et d'animaux indigènes d'IdF sur le plateau de Paris-Saclay pré-verger (2019-2021)