En savoir plus

Notre utilisation de cookies

« Cookies » désigne un ensemble d’informations déposées dans le terminal de l’utilisateur lorsque celui-ci navigue sur un site web. Il s’agit d’un fichier contenant notamment un identifiant sous forme de numéro, le nom du serveur qui l’a déposé et éventuellement une date d’expiration. Grâce aux cookies, des informations sur votre visite, notamment votre langue de prédilection et d'autres paramètres, sont enregistrées sur le site web. Cela peut faciliter votre visite suivante sur ce site et renforcer l'utilité de ce dernier pour vous.

Afin d’améliorer votre expérience, nous utilisons des cookies pour conserver certaines informations de connexion et fournir une navigation sûre, collecter des statistiques en vue d’optimiser les fonctionnalités du site. Afin de voir précisément tous les cookies que nous utilisons, nous vous invitons à télécharger « Ghostery », une extension gratuite pour navigateurs permettant de les détecter et, dans certains cas, de les bloquer.

Ghostery est disponible gratuitement à cette adresse : https://www.ghostery.com/fr/products/

Vous pouvez également consulter le site de la CNIL afin d’apprendre à paramétrer votre navigateur pour contrôler les dépôts de cookies sur votre terminal.

S’agissant des cookies publicitaires déposés par des tiers, vous pouvez également vous connecter au site http://www.youronlinechoices.com/fr/controler-ses-cookies/, proposé par les professionnels de la publicité digitale regroupés au sein de l’association européenne EDAA (European Digital Advertising Alliance). Vous pourrez ainsi refuser ou accepter les cookies utilisés par les adhérents de l'EDAA.

Il est par ailleurs possible de s’opposer à certains cookies tiers directement auprès des éditeurs :

Catégorie de cookie

Moyens de désactivation

Cookies analytiques et de performance

Realytics
Google Analytics
Spoteffects
Optimizely

Cookies de ciblage ou publicitaires

DoubleClick
Mediarithmics

Les différents types de cookies pouvant être utilisés sur nos sites internet sont les suivants :

Cookies obligatoires

Cookies fonctionnels

Cookies sociaux et publicitaires

Ces cookies sont nécessaires au bon fonctionnement du site, ils ne peuvent pas être désactivés. Ils nous sont utiles pour vous fournir une connexion sécuritaire et assurer la disponibilité a minima de notre site internet.

Ces cookies nous permettent d’analyser l’utilisation du site afin de pouvoir en mesurer et en améliorer la performance. Ils nous permettent par exemple de conserver vos informations de connexion et d’afficher de façon plus cohérente les différents modules de notre site.

Ces cookies sont utilisés par des agences de publicité (par exemple Google) et par des réseaux sociaux (par exemple LinkedIn et Facebook) et autorisent notamment le partage des pages sur les réseaux sociaux, la publication de commentaires, la diffusion (sur notre site ou non) de publicités adaptées à vos centres d’intérêt.

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit des cookies sessions CAS et PHP et du cookie New Relic pour le monitoring (IP, délais de réponse).

Ces cookies sont supprimés à la fin de la session (déconnexion ou fermeture du navigateur)

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit du cookie XiTi pour la mesure d’audience. La société AT Internet est notre sous-traitant et conserve les informations (IP, date et heure de connexion, durée de connexion, pages consultées) 6 mois.

Sur nos CMS EZPublish, il n’y a pas de cookie de ce type.

Pour obtenir plus d’informations concernant les cookies que nous utilisons, vous pouvez vous adresser au Déléguée Informatique et Libertés de l’INRA par email à cil-dpo@inra.fr ou par courrier à :

INRA
24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

Menu Logo Principal Logo tutelles

LabEx BASC

Lutter contre la 'pollution génétique' du pommier sauvage par le pommier cultivé

PomFlux
Le projet a conduit notamment à réglementer la réimplantation de pommiers sauvages pour éviter de réintroduire des individus hybrides. Photo: Pommier sauvage européen Malus sylvestris à Fontainebleau (©A. Cornille)
Tatiana Giraud

Intitulé et acronyme du projet: Facteurs anthropiques et conséquences des flux de gènes cultivés-sauvages chez la pomme - PomFlux

Le projet PomFlux a été financé dans le cadre de l'Appel à projet Blanc 2014 et du projet phare 2 "Comprendre et améliorer les capacités adaptatives des agroécosystèmes par la connaissance de la génétique et de l'évolution". Il s'est déroulé sur 2 ans (2015-2016).

Porteuse du projet : Tatiana GIRAUD (ESE)

Partenaires

  • Équipes BASC : GQE-Le Moulon
  • AFAF
    Équipes extérieures : IRSTEA
  • Partenaires non académiques : Association Française d’Agroforesterie (AFAF)

Ce projet visait à soutenir une collaboration entre les laboratoires ESE et Moulon, et des partenaires non académiques, pour

  1. comprendre les facteurs anthropiques qui influencent les probabilités de flux de gènes du pommier cultivé Malus domestica vers le pommier sauvage M. sylvestris (notamment la fragmentation du paysage, le nombre ou la surface des vergers, ou les changements de pollinisateurs),
  2. déterminer quelles régions génomiques sont concernées par ces flux de gènes (notamment régions codantes ou non, contenant des gènes particuliers) et si elles ont un impact sur l’adaptation (en regardant si les régions génomiques montrent des signatures de sélection et en réalisant des tests de valeurs sélectives),
  3. déterminer si les plants de pommiers sauvages vendus en pépinières sont des hybrides et recommander des pratiques de conservation et reforestation du pommier sauvage en agroforesterie.

Ce projet visait aussi à acquérir des données préliminaires pour le dépôt de projets ANR et européens.

Le projet a permis:

  1. d’évaluer la diversité génétique et la structuration des populations françaises de pommiers sauvages, en révélant l’existence de groupes génétiques différents en France; 
  2. de révéler de forts niveaux d’introgression (c’est-à-dire d’incorporation de matériel génétique par hybridation) du pommier sauvage par le pommier cultivé ; 
  3. de montrer que cette « pollution génétique » dépend du degré d’anthropisation de la région et de l’intensité de la culture du pommier
  4. d’identifier des populations « pures » de pommiers sauvages, non introgressées par le pommier domestique, et provenant des différents grands groupes génétiques existant en France, pour établir des vergers conservatoires de pommiers sauvages, qui puissent servir à la réintroduction d’arbres dans les écosystèmes forestiers et agroforestiers ; 
  5. de montrer que les filières de réimplantation des pommiers sauvages ne fournissent au mieux que des hybrides
  6. des vergers conservatoires sont en cours de construction.
  7. de promulguer un Arrêté ministériel réglementant la réimplantation de pommiers sauvages pour éviter de réintroduire des individus hybrides
Extrait arrêté PomFlux

Extrait de l'Arrêté du 3 novembre 2015

Publications 

Figure publi PomFlux - Anthropogenic and natural drivers of gene flow in a temperate wild fruit tree: a basis for conservation and breeding program...

> Cornille A., Feurtey A, Gélin U, Misvanderbrugge K., Gladieux P, Ropars J, Giraud T. 2015. Anthropogenic and natural drivers of gene flow in a temperate wild fruit tree: a basis for conservation and breeding programs in apples. Evol App. 8: 373–384, https://doi.org/10.1111/eva.12250 (article relayé dans une brève de l’INEE et dans BioFutur). Résumé: "Gene flow is an essential component of population adaptation and species evolution. Understanding of the natural and anthropogenic factors affecting gene flow is also critical for the development of appropriate management, breeding, and conservation programs. Here, we explored the natural and anthropogenic factors impacting crop-to-wild and within wild gene flow in apples in Europe using an unprecedented dense sampling of 1889 wild apple (Malus sylvestris) from European forests and 339 apple cultivars (Malus domestica). We made use of genetic, environmental, and ecological data (microsatellite markers, apple production across landscapes and records of apple flower visitors, respectively). We provide the first evidence that both human activities, through apple production, and human disturbance, through modifications of apple flower visitor diversity, have had a significant impact on crop-to-wild interspecific introgression rates. Our analysis also revealed the impact of previous natural climate change on historical gene flow in the nonintrogressed wild apple M. sylvestris, by identifying five distinct genetic groups in Europe and a north–south gradient of genetic diversity. These findings identify human activities and climate as key drivers of gene flow in a wild temperate fruit tree and provide a practical basis for conservation, agroforestry, and breeding programs for apples in Europe."       Illustration: "Geographical quantification of introgression rates and numbers of hybrids among European wild apple sites in Europe and, more specifically, in France."

Figure publi PomFlux - Crop-to-wild gene flow and its fitness consequences for a wild fruit tree: Towards a comprehensive conservation strategy of...

> Feurtey A, Cornille A, Snirc A, Shykoff J, Giraud T. 2016 Crop-to-wild gene flow and its fitness consequences on a wild fruit tree: towards a comprehensive conservation strategy of the wild apple in Europe. Evol App. 10 (2), 180-188. Résumé: "Crop-to-wild gene flow can reduce the fitness and genetic integrity of wild species. Malus sylvestris, the European crab-apple fruit tree in particular, is threatened by the disappearance of its habitat and by gene flow from its domesticated relative, Malus domestica. With the aims of evaluating threats for M. sylvestris and of formulating recommendations for its conservation, we studied here, using microsatellite markers and growth experiments: (i) hybridization rates in seeds and trees from a French forest and in seeds used for replanting crab apples in agrosystems and in forests, (ii) the impact of the level of M. domestica ancestry on individual tree fitness and (iii) pollen dispersal abilities in relation to crop-to-wild gene flow. We found substantial contemporary crop-to-wild gene flow in crab-apple tree populations and superior fitness of hybrids compared to wild seeds and seedlings. Using paternity analyses, we showed that pollen dispersal could occur up to 4 km and decreased with tree density. The seed network furnishing the wild apple reintroduction agroforestry programmes was found to suffer from poor genetic diversity, introgressions and species misidentification. Overall, our findings indicate supported threats for the European wild apple steering us to provide precise recommendations for its conservation."                (Illustration: "Spatial distribution of apple trees in the study area. Trees are represented by dots, and their colour indicates their degree of Malus domestica ancestry (Pdom): green, Pdom < 0.2; red, Pdom > 0.8; and yellow, intermediate. The seed orchard is circled in black")

Vulgarisation

Forêt entreprise - Publi PomFlux

Articles de vulgarisation

> Feurtey A. Domestication, une révolution à l’origine de la civilisation : Découverte n°402, janvier-février 2016

<=== Giraud H, Cornille A, Giraud T 2016. Pommiers sauvage et cultivé : ce que la génétique nous apprend de leurs liens passés et présents sur leurs conservation et réimplantation futures ; Forêt Entreprise 229:26-29

> Giraud T et Branca A (2015) Quand l'homme perfectionne les espèces végétales. Les échos.

Autres éléments de vulgarisation

> Intervention à la Maison des Sciences de Chatenay-Malabry

> Héloïse, A la recherche des pommiers sauvages, 2017, Graines de Mane, site internet de vulgarisation en agriculture (ci-bas)

Publi Graines de Mane -PomFlux

> Intervention à la Fête de la Science 2015 devant des classes de lycée général; Intervention par visioconférence au lycée Anna Judic de Semur en Auxois (Côte d’Or) devant une classe de Terminale Scientifique; Conférence de vulgarisation : « La domestication » Association Chercheurs Toujours, Paris Institut CurieIntervention devant des classes de Terminale Scientifique du lycée de Saint Cloud en mai 2015 

> Mise en place d’un TD de Terminale Scientifique répondant au programme de l’Education Nationale et similaire aux épreuves du Bac avec un enseignant de Fontenay-sous-Bois (M. Farina) et ayant été transmis au rectorat.

> Intervention devant une classe de primaire (CE2) de Chatenay Malabry en 2015

> Intervention à la Fête de la Science 2013 devant des classes de lycée agricole; intervention au lycée agricole d’Igny devant des classes de première en 2015

> Dépliant pour le Salon de l’agriculture avec Cervia 2013

Voir aussi

  • Comprendre et améliorer les capacités adaptatives des agroécosystèmes par la connaissance de la génétique et de l'évolution - Projet phare 2 (2013-2016
  • Impact de la domestication sur l’adaptation d’insectes ravageurs suceurs‐piqueurs chez les arbres fruitiers : vers une lutte biologique contre les pucerons chez les pommiers ? PomPuceDom (2017-2018)
  • Mise en place d'un pré-verger conservatoire d'espèces de plantes et d'animaux indigènes d'IdF sur le plateau de Paris-Saclay pré-verger (2019-2021)