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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Anatomie pathologique Sante Animale

Zone de texte éditable et éditée

Initiation au traitement et à l'analyse d'images avec ImageJ

Objectifs : Découvrir les bases du logiciel ImageJ / Acquérir les bases du traitement et de l'analyse des images numériques en biologie.

inserm

DR Grand Ouest Formation Continue
Durée de la formation : 4 jours

Programme de la formation

  • S’initier à Image J : installation d’image J, bien le configurer, maitrise du menu de base, installation de plugins
  • Principe de l’acquisition de l’image : diffraction, échantillonnage, résolution
  • Comprendre une image : pixel/voxel, palette des couleurs, histogramme, formats
  • Manipulation des images : stacks, hyper stacks, compression, redimensionnement, dynamique, fonctions arithmétiques
  • Filtres : les différents filtres utilisables, du flou à Fourier
  • Mesure de base sur les images : calibration d’images
  • Quantification : principe du seuillage, segmentation d’objets, création de régions d’intérêt, mesures diverses, co-localisation
  • Introduction aux étapes d’une chaine de traitements d’image. Automatisation d’un processus
  • Quelques Plugins intéressants

  • Méthodes : Principes théoriques, travaux pratiques sur les 4 jours de formation et applications sur des images des participants.



    Dates : 28-29 Mai et 8-9 Juin 2015
    Lieu : Nantes
    Public : Tout public souhaitant s’initier à l’analyse d’images et utiliser Image J
    Pré-requis : Il est conseillé de venir à la formation avec un ordinateur portable et des images à analyser
    Responsable de la formation :
    Michèle HAYS
    INSERM DR Grand Ouest
    63, quai Magellan, CS 32116, 44021 NANTES Cedex 1
    Tél : 02 40 35 86 80
    Fax : 02 40 47 77 01
    Mail : michele.hays@inserm.fr 
    Intervenants :
    Laurence Dubreil (Oniris)
    Philippe Hulin (Inserm)
    Steven Nedellec (Université)
    Perrine Paul-Guilloteaux (Cnrs)