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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Anatomie pathologique Sante Animale

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Formation en histologie, bio-imagerie à fluorescence, vidéomicroscopie et microdissection laser sur les plateformes MicroPICell ( IRS UN) et APEX (Oniris)

Formation en histologie, bio-imagerie à fluorescence, vidéomicroscopie et microdissection laser sur les plateformes MicroPICell ( IRS UN) et APEX (Oniris)

Dates 7-10 mars 2017

Objectifs

  • Acquérir une formation de base théorique et pratique en microscopie : Microscopie confocale, spectrale, biphotonique, TIRF, SIM, PALM/STROM, vidéo microscopie et microdissection laser.
  • Acquérir une formation de base théorique et technologique en histologie, immunohistochimie.
  • Acquérir une formation de base théorique sur la validation d’un modèle animal.
  • Connaître les modalités d’accès et d’utilisation des PF et à certains appareils.
  • Initiation à l’analyse d’image.

 

 

Programme de la formation

Horaires sur MicroPicell 7 Mars 9-17h, 8 Mars 9h30-17h30

Planning: 4  jours ( 2 jours sur MicroPICell et 2 jours sur APEX)

1-     Microscopie confocale, vidéomicroscopie et microscopie SIM  (Philippe Hulin, Steven Nedellec et Stéphanie Blandin, µPiCell, IRT UN)

Formation théorique 4 heures (Jour 1)

  • Préparation des échantillons : principe théorique (Stéphanie Blandin, MicroPICell, site IRS UN)
  • Colorations standards et spéciales (Stéphanie Blandin,  MicroPICell, site IRS UN)
  • Principes d’immunohistochimie et d’immunofluorescence
  • Tissue-MicroArrays

 

  • Rappel des bases de la microscopie photonique. Introduction à la microscopie confocale , microscopie SIM (Philippe Hulin et Steven Nedellec, MicroPICell, site IRS UN)

 

Formation pratique 12 heures (jour 1+2)

 

  • Initiation à la préparation des échantillons histologiques (paraffine et congélation) (Stéphanie Blandin, MicroPICell, site IRS UN)(4h)
  • Observation de différentes colorations sur différents tissus, sur le microscope photonique multi-têtes.
  • Formation à l’utilisation d’un microscope confocal et/ou vidéo microscope, microscope SIM (Philippe Hulin et Steven Nedellec, MicroPICell, site IRS UN)(6h)
  • analyses des résultats : initiation pratique au traitement et àl’analyse d’images (Perrine Paul-Gilloteaux, Site IRS UN) (2h)

 

 

Horaires sur APEX 9 Mars 9-17h, 10 Mars 9-17h

                                                                   

2-     Microscopie spectrale, TIRF, PALM/STROM, biphotonique, histopathologie et microdissection laser (Laurence Dubreil, Thibaut Larcher, Candice Babarit, Lydie Guigand, Romain Fleurisson APEX-UMR703, Oniris)

 

Formation théorique 4 heures (9 Mars)

  • § Validation d’un modèle animal (Thibaut Larcher)(1h15)
  • § L’immunomarquage en fluorescence pour le phénotypage tissulaire (Lydie  Guigand) (1h)
  • § Introduction à la microscopie confocale spectrale,  biphotonique, TIRF, PALM/STORM (Laurence Dubreil ) (1h15)
  • § Introduction à la microdissection laser (Candice Babarit)(30 min)

 

Formation pratique 12 heures (9 et 10 Mars)

  • § Immunomarquages fluorescents  sur coupe de tissus pour la microscopie confocale et la microscopie STORM (Lydie Guigand, APEX-URM703, site Oniris)
  • § Initiation à l’utilisation d’un microscope confocal spectral, TIRF, biphotonique, PALM/STORM, microdissection laser (Laurence Dubreil, Romain Fleurisson, Candice Babarit,APEX-UMR70, site Oniris)
  • § Lecture de lames, application validation d’un modèle animal (Thibaut Larcher APEX-UMR703)

 

  • § Méthode pédagogique

Les encadrants transmettent  leurs connaissances sous forme d’exposé et d’échanges, c’est la phase théorique. Au cours de la phase pratique, les encadrants montrent, font faire et font dire. L’étudiant acquiert un savoir faire en microscopie et préparation des échantillons.

 

Lieu : Plateforme MicroPiCell (IRS UN, Nantes), Plateforme APEX (Oniris, Nantes)

Type de formation : formation théorique et pratique en microscopie, histologie, analyse d’image à destination des doctorants

Durée de la formation : 2 X 4 jours (mars 2017)

Public visé : Doctorants

Prérequis : Pas de pré-requis obligatoire pour un accès à la plate-forme

Capacité d’accueil : 5X2 ( 5 étudiants max par session)

Matériel à apporter : Indiquer s’il faut apporter du matériel

Coût : APEX : 80 euros par étudiant, MicroPiCell  80 euros par étudiant soit 160 euros au total par étudiant pour 4 jours de formation.

Organisme de formation : co-portage Oniris/SFR

Co-responsables de la formation

Philippe Hulin, Plateforme MicroPiCell Tel : 02 28 08 03 28

philippe.hulin@univ-nantes.fr

Laurence Dubreil, Plateforme APEX Tel : 02 68 78 73 , 40-31

laurence.dubreil@oniris-nantes.fr